253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0084 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
154 aa  321  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  99.35 
 
 
154 aa  320  6e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  98.7 
 
 
154 aa  317  5e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  97.18 
 
 
142 aa  291  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  88.96 
 
 
150 aa  286  9e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  94.37 
 
 
146 aa  285  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  88.31 
 
 
150 aa  284  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  93.66 
 
 
142 aa  283  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  86.93 
 
 
150 aa  278  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  76.43 
 
 
141 aa  229  7e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  76.98 
 
 
142 aa  229  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  73.94 
 
 
142 aa  221  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  68.09 
 
 
143 aa  213  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  72.54 
 
 
144 aa  213  9e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  67.14 
 
 
140 aa  204  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  69.53 
 
 
144 aa  202  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  62.02 
 
 
149 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  58.14 
 
 
150 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  56.59 
 
 
150 aa  164  3e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  42.75 
 
 
146 aa  132  1e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
139 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
161 aa  94  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  36.67 
 
 
161 aa  92.8  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  36.5 
 
 
149 aa  84  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  1.87556e-06  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.94 
 
 
139 aa  82.8  1e-15  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04590  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
291 aa  79.7  1e-14  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
156 aa  79  3e-14  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
156 aa  78.2  4e-14  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  34.38 
 
 
134 aa  77.8  5e-14  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
136 aa  77.8  6e-14  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.72 
 
 
137 aa  75.5  3e-13  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
167 aa  73.2  1e-12  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
139 aa  72.8  2e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
136 aa  72.4  2e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
140 aa  71.2  4e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
142 aa  70.1  1e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.7 
 
 
130 aa  68.9  2e-11  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
132 aa  68.6  3e-11  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  27.59 
 
 
147 aa  68.6  3e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  29.82 
 
 
130 aa  68.6  3e-11  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  26.32 
 
 
134 aa  68.2  4e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
156 aa  67.8  5e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
136 aa  67.4  6e-11  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
143 aa  66.2  1e-10  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
146 aa  66.6  1e-10  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
131 aa  67  1e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
143 aa  66.6  1e-10  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
135 aa  66.6  1e-10  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 
146 aa  66.6  1e-10  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
143 aa  66.6  1e-10  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
132 aa  66.2  2e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  26.98 
 
 
134 aa  66.2  2e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
139 aa  65.9  2e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03599  conserved hypothetical protein  34.06 
 
 
294 aa  65.1  3e-10  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
140 aa  64.7  4e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
133 aa  63.9  7e-10  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  63.9  7e-10  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
132 aa  63.9  8e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
153 aa  63.9  8e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
140 aa  62.4  2e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 
153 aa  62.4  2e-09  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 
153 aa  62.4  2e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  39.51 
 
 
147 aa  62.4  2e-09  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
139 aa  62  3e-09  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.82 
 
 
145 aa  61.6  4e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  28.97 
 
 
149 aa  60.8  6e-09  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
145 aa  60.5  9e-09  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  28.46 
 
 
159 aa  58.9  2e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  24.39 
 
 
146 aa  59.3  2e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  32.94 
 
 
213 aa  59.3  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  58.9  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  25.9 
 
 
151 aa  58.9  3e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  58.9  3e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  3.80649e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
133 aa  58.9  3e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  28.46 
 
 
143 aa  58.9  3e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
145 aa  58.2  4e-08  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
144 aa  58.2  4e-08  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  26.76 
 
 
155 aa  57.8  6e-08  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  1.53197e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
164 aa  57.8  6e-08  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  2.26869e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  26.03 
 
 
180 aa  57.8  6e-08  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  26.71 
 
 
147 aa  57.4  7e-08  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  7.91205e-06  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
137 aa  57.4  7e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
143 aa  57  9e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  34.07 
 
 
155 aa  56.6  1e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
148 aa  56.6  1e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  26.39 
 
 
145 aa  56.6  1e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  26.17 
 
 
153 aa  56.2  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
148 aa  55.5  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.27 
 
 
148 aa  56.2  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
135 aa  56.2  2e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.69 
 
 
149 aa  55.8  2e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.92 
 
 
148 aa  55.5  2e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>