65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0083 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0080  hypothetical protein  97.7 
 
 		 87 aa  180  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0084  hypothetical protein  96.55 
 
 		 87 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0079  hypothetical protein  83.91 
 
 		 88 aa  159  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0085  hypothetical protein  81.61 
 
 		 88 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0065  hypothetical protein  80.46 
 
 		 88 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0079  hypothetical protein  79.31 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0082  hypothetical protein  79.31 
 
 		 87 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3774  acetyltransferase-like  67.53 
 
 		 108 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.463282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4184  hypothetical protein  65.33 
 
 		 82 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3969  hypothetical protein  59.49 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0071  hypothetical protein  61.04 
 
 		 79 aa  100  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4858  hypothetical protein  53.16 
 
 		 81 aa  98.2  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4457  hypothetical protein  53.16 
 
 		 85 aa  89.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2274  hypothetical protein  40 
 
 		 95 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000000180646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2072  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000410313  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3817  hypothetical protein  40.96 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.4231  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2553  acetyltransferase-like protein  38.75 
 
 		 94 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000305824  hitchhiker  0.000000000000131346 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3559  hypothetical protein  39.77 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41930  hypothetical protein  38.37 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2946  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1924  hypothetical protein  38.75 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000705286  hitchhiker  0.00000000000000488804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3447  hypothetical protein  38.75 
 
 		 93 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000030181  hitchhiker  0.000684662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1764  hypothetical protein  38.75 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000155918  hitchhiker  0.000000000000406701 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2323  hypothetical protein  38.75 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000526442  hitchhiker  0.0000374352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4010  hypothetical protein  38.75 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057579  normal  0.556915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2206  hypothetical protein  36.71 
 
 		 90 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.788583 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2243  acetyltransferase-like protein  31.65 
 
 		 93 aa  63.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23120  hypothetical protein  36.25 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000670372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2664  hypothetical protein  31.46 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0595784 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0132  hypothetical protein  26.58 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1594  hypothetical protein  34.62 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0106902  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2713  hypothetical protein  31.08 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.550413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2724  hypothetical protein  32.56 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0839227  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3163  hypothetical protein  32.89 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.919705  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0141  hypothetical protein  25.32 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1808  acetyltransferase  36.36 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2768  hypothetical protein  30.95 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1574  hypothetical protein  33.77 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1807  acetyltransferase-like  30.77 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2765  hypothetical protein  29.87 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00670  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.83104  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05101  acetyltransferase  30.49 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0210  acetyltransferase  32.89 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1537  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4391  hypothetical protein  26.58 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.946399  normal  0.0400185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1761  acetyltransferase  32.47 
 
 		 123 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0128615  normal  0.0715534 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5465  hypothetical protein  28.57 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3723  hypothetical protein  29.87 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2603  hypothetical protein  28.21 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3334  putative acetyltransferase protein  31.08 
 
 		 92 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.474868 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2082  acetyltransferase  30.49 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3739  acetyltransferase-like protein  34.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2596  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2544  acetyltransferase-like protein  31.25 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0495517  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1003  hypothetical protein  38.36 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709962  normal  0.531715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02810  predicted acetyltransferase  28.4 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2008  hypothetical protein  29.67 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0194  acetyltransferase-like protein  32.88 
 
 		 113 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3077  putative acetyltransferase protein  33.87 
 
 		 92 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.402192 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0090  hypothetical protein  26.58 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000798856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0163  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.386761  normal  0.125352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0999  hypothetical protein  29.49 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.833549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2744  acetyltransferase-like  36.25 
 
 		 377 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.505103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>