129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0080 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0080  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  285  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0078  thioesterase superfamily protein  99.26 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0082  thioesterase superfamily protein  99.26 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.691992 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  95.59 
 
 
136 aa  274  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  95.59 
 
 
136 aa  274  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  95.56 
 
 
136 aa  272  9e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  94.85 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  93.38 
 
 
136 aa  268  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0077  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  91.73 
 
 
138 aa  257  4e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  70.15 
 
 
134 aa  200  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  67.67 
 
 
134 aa  196  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3570  thioesterase superfamily protein  71.32 
 
 
132 aa  194  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0073  thioesterase superfamily protein  64.18 
 
 
135 aa  191  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  63.43 
 
 
134 aa  191  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4458  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
134 aa  189  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.913504 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  63.64 
 
 
155 aa  187  5e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  48.39 
 
 
133 aa  133  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  51.69 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0145  thioesterase superfamily protein  53.45 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0929  thioesterase family protein  42.28 
 
 
131 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3038  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
136 aa  122  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.461873  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  43.09 
 
 
137 aa  120  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  40.94 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  44.63 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  44.63 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  44.63 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  43.2 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1443  hypothetical protein  43.33 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  39.02 
 
 
133 aa  107  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3185  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
143 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
132 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0257  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
147 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  27.94 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
163 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  24.06 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  23.81 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  29.13 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  24.41 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.61 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  24.53 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 
136 aa  48.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  25.19 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0960  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
283 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
147 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
147 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02013  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  29.41 
 
 
136 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.43 
 
 
138 aa  47  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  27.69 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.95 
 
 
148 aa  47  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  25 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  31.82 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.12 
 
 
137 aa  45.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  29.35 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 
145 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  28.3 
 
 
137 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0817  thioesterase family protein  24.18 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  28 
 
 
138 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
149 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>