More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0067 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
319 aa  662  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  98.43 
 
 
319 aa  648  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  2.96005e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  99.37 
 
 
319 aa  658  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  79.94 
 
 
319 aa  539  1e-152  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  80.25 
 
 
319 aa  539  1e-152  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  79.94 
 
 
319 aa  535  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  79.62 
 
 
319 aa  534  1e-151  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  61.95 
 
 
319 aa  400  1e-110  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  40.31 
 
 
323 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  38.39 
 
 
336 aa  209  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  39.88 
 
 
323 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  37.61 
 
 
337 aa  184  1e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  37.97 
 
 
328 aa  184  2e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  37.81 
 
 
335 aa  184  2e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  37.19 
 
 
343 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  36.36 
 
 
338 aa  173  3e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  36.05 
 
 
338 aa  173  3e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  35.8 
 
 
322 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  36.7 
 
 
331 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  30.43 
 
 
322 aa  161  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  36.39 
 
 
337 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 
317 aa  156  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  34.39 
 
 
298 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  35.5 
 
 
311 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.42 
 
 
326 aa  153  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  34.94 
 
 
304 aa  152  6e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  35.99 
 
 
304 aa  152  6e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  33.44 
 
 
308 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.65 
 
 
311 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  33.02 
 
 
323 aa  149  5e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  33.87 
 
 
306 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.65 
 
 
307 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  32.29 
 
 
319 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  32.29 
 
 
319 aa  142  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.55 
 
 
307 aa  141  2e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  29.05 
 
 
319 aa  140  2e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.66 
 
 
319 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.78 
 
 
319 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 
322 aa  139  5e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  32.3 
 
 
319 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  31.97 
 
 
319 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.37 
 
 
323 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.88 
 
 
323 aa  135  1e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  28.17 
 
 
321 aa  129  7e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  31.58 
 
 
315 aa  126  4e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  30.91 
 
 
313 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.38 
 
 
355 aa  126  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  5.23624e-08  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  30.91 
 
 
313 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  30.91 
 
 
313 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  32.69 
 
 
309 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 
319 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 
319 aa  126  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  31.27 
 
 
315 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.85 
 
 
320 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 
319 aa  123  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.05 
 
 
314 aa  122  7e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  30.56 
 
 
313 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.77 
 
 
325 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  1.03669e-05  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  30.86 
 
 
312 aa  121  1e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 
322 aa  121  1e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  30.25 
 
 
313 aa  121  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  29.19 
 
 
310 aa  119  5e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  30.84 
 
 
306 aa  118  1e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 
316 aa  118  1e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  29.91 
 
 
315 aa  117  4e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  31.78 
 
 
322 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 
315 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.82 
 
 
316 aa  112  7e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  29.78 
 
 
307 aa  112  1e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  30.56 
 
 
323 aa  112  1e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.43 
 
 
323 aa  110  2e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  31.33 
 
 
310 aa  111  2e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  31.41 
 
 
310 aa  111  2e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.75 
 
 
320 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.82 
 
 
316 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  29.87 
 
 
309 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  30.22 
 
 
324 aa  109  7e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  31.99 
 
 
316 aa  109  7e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 
321 aa  108  9e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
311 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 
319 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  26.58 
 
 
326 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  29.23 
 
 
319 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  28.41 
 
 
332 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 
312 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  29.84 
 
 
321 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 
316 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  29.56 
 
 
320 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  29.04 
 
 
318 aa  104  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  29.78 
 
 
312 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  29.94 
 
 
306 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
320 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  29.33 
 
 
338 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.7 
 
 
347 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  29.5 
 
 
306 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  28.92 
 
 
326 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  28.91 
 
 
346 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  31.27 
 
 
315 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  30.65 
 
 
312 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  27.8 
 
 
334 aa  99.4  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>