More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0058 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_4298  major facilitator transporter  96.86 
 
 
414 aa  715  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000777962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0058  major facilitator transporter  100 
 
 
414 aa  822  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000719685  decreased coverage  7.8318e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0060  major facilitator superfamily MFS_1  96.62 
 
 
414 aa  714  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0056  major facilitator transporter  98.55 
 
 
414 aa  810  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00977888  hitchhiker  0.000481777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0056  major facilitator transporter  97.34 
 
 
414 aa  718  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0061  major facilitator transporter  97.34 
 
 
414 aa  720  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0161323  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4042  major facilitator family transporter  71.83 
 
 
402 aa  555  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3979  major facilitator family transporter  71.83 
 
 
400 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03348  hypothetical protein  71.83 
 
 
402 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4923  inner membrane protein YhjX  70.74 
 
 
400 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3748  major facilitator family transporter  71.83 
 
 
402 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0165  Oxalate/Formate Antiporter  71.83 
 
 
402 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03397  predicted transporter  71.83 
 
 
402 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0169  oxalate/formate antiporter  71.83 
 
 
402 aa  553  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.86802  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3868  major facilitator family transporter  70.23 
 
 
402 aa  548  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0177  oxalate/formate antiporter  67.76 
 
 
400 aa  549  1e-155  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  48.85 
 
 
408 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 
405 aa  373  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 
407 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 
407 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  44.75 
 
 
402 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  44.75 
 
 
402 aa  360  3e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2442  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 
405 aa  359  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.234485  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  46.25 
 
 
402 aa  352  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  46.25 
 
 
402 aa  353  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  45.25 
 
 
402 aa  352  9e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  45.75 
 
 
402 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  44.25 
 
 
402 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  44 
 
 
402 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  45.05 
 
 
402 aa  345  6e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  45.6 
 
 
400 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  44 
 
 
402 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  45.57 
 
 
400 aa  335  6e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2203  oxalate:formate antiporter  45.32 
 
 
400 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.111639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2142  oxalate/formate antiporter  45.32 
 
 
400 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0401795  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2126  oxalate/formate antiporter  45.32 
 
 
400 aa  335  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0875766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2385  putative oxalate:formate antiporter  45.32 
 
 
400 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2367  oxalate:formate antiporter  45.32 
 
 
400 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  44.81 
 
 
400 aa  334  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  44.56 
 
 
400 aa  332  8e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  43.69 
 
 
402 aa  322  6e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2467  putative oxalate:formate antiporter  45.54 
 
 
358 aa  284  2e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.34244e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0886  major facilitator superfamily permease  31.92 
 
 
461 aa  206  6e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0290248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2394  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 
414 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.1703e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0936  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 
407 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  30.77 
 
 
418 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  28.22 
 
 
418 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  27.96 
 
 
410 aa  155  9e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  25.51 
 
 
398 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  25.51 
 
 
398 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  25 
 
 
398 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  28.42 
 
 
397 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
415 aa  150  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  28.71 
 
 
411 aa  150  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
425 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  28.03 
 
 
412 aa  145  9e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2465  major facilitator transporter  28.24 
 
 
454 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000297  oxalate/formate antiporter  26.83 
 
 
412 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.77663e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 
408 aa  144  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
421 aa  142  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
421 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.79 
 
 
421 aa  140  4e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  27.39 
 
 
412 aa  140  4e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06098  hypothetical protein  26.65 
 
 
410 aa  139  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05082  hypothetical protein  26.91 
 
 
404 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.09 
 
 
442 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 
411 aa  137  3e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  25.8 
 
 
391 aa  137  3e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.43521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2490  oxalate/formate antiporter, putative  27.79 
 
 
455 aa  135  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  24.75 
 
 
419 aa  135  1e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
416 aa  135  1e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  27.15 
 
 
413 aa  134  2e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3142  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
434 aa  133  4e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.13 
 
 
412 aa  131  3e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 
453 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  28.32 
 
 
431 aa  130  5e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
453 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  27.08 
 
 
442 aa  127  4e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 
429 aa  127  4e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3434  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
421 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  26.37 
 
 
430 aa  126  8e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 
430 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4475  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
441 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.220885  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3283  major facilitator transporter  26.75 
 
 
429 aa  121  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21568  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5265  major facilitator transporter  26.75 
 
 
429 aa  121  2e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.940755  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  25.5 
 
 
422 aa  120  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4329  major facilitator transporter  25.27 
 
 
438 aa  118  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0362364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  26.7 
 
 
406 aa  117  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  23.09 
 
 
433 aa  116  7e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  26.67 
 
 
401 aa  115  1e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4366  major facilitator superfamily transporter  25.89 
 
 
447 aa  115  1e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.370471  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  25.48 
 
 
431 aa  115  1e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  25.49 
 
 
432 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0904  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 
393 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  27.76 
 
 
424 aa  112  1e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24130  sugar phosphate permease  23.86 
 
 
436 aa  111  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5557  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
450 aa  111  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2154  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
430 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>