More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0055 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0055  pirin domain-containing protein  100 
 
 
307 aa  631  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.41022e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0053  pirin domain-containing protein  98.37 
 
 
307 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0030122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0061  pirin domain-containing protein  97.08 
 
 
308 aa  613  1e-174  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.22873e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0050  pirin domain-containing protein  83.71 
 
 
307 aa  547  1e-155  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0017274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0058  pirin domain-containing protein  84.69 
 
 
307 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  5.80792e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0057  Pirin domain protein  84.04 
 
 
307 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4301  pirin domain-containing protein  83.71 
 
 
307 aa  541  1e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.411445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0053  pirin domain-containing protein  82.41 
 
 
307 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3541  pirin-like protein  65.51 
 
 
297 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1778  Pirin-like protein  61.28 
 
 
313 aa  382  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2835  pirin domain-containing protein  53.23 
 
 
313 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0050  Pirin-like protein  56.61 
 
 
301 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4173  hypothetical protein  54.36 
 
 
332 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48730  hypothetical protein  54.7 
 
 
315 aa  329  4e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3147  Pirin domain protein  54.58 
 
 
301 aa  310  3e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.933167  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0919  pirin domain-containing protein  47.57 
 
 
338 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200809  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2304  pirin domain-containing protein  41.69 
 
 
310 aa  244  9e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  4.53876e-07  normal  0.0236921 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1645  Pirin domain protein  42.81 
 
 
324 aa  232  8e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0490  Pirin domain protein  43.91 
 
 
322 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0687764  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35540  Pirin-related protein  34.55 
 
 
381 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2245  hypothetical protein  40.15 
 
 
332 aa  200  2e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.169099  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2558  Pirin domain protein  39.43 
 
 
336 aa  201  2e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13123e-08 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5391  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
317 aa  199  4e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5681  pirin domain-containing protein  39.26 
 
 
317 aa  199  4e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5302  Pirin-like protein  39.26 
 
 
317 aa  199  4e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.178895  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0062  pirin domain-containing protein  38.97 
 
 
321 aa  199  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0100  Pirin domain protein  38 
 
 
335 aa  197  2e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2016  Pirin domain protein  38.03 
 
 
343 aa  197  2e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.656131  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3190  Pirin domain protein  38.14 
 
 
351 aa  197  2e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3726  Pirin domain protein  38.65 
 
 
336 aa  196  5e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4144  Pirin domain protein  35.74 
 
 
329 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.173069  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0663  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
351 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0788  pirin domain-containing protein  37.59 
 
 
321 aa  193  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3781  Pirin-like  41.22 
 
 
294 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.871122 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2745  Pirin domain-containing protein  36.71 
 
 
319 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.211686  normal  0.964257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2844  pirin domain-containing protein  35.53 
 
 
363 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.923717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3633  Pirin domain protein  35.5 
 
 
330 aa  187  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0508  Pirin domain protein  35.55 
 
 
329 aa  186  4e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  decreased coverage  3.44824e-07 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0273  Pirin-like protein  38.01 
 
 
291 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.355193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3573  Pirin domain protein  37.68 
 
 
307 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0326  Pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.24 
 
 
291 aa  184  2e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3641  Pirin domain protein  37.32 
 
 
307 aa  183  4e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3476  Pirin domain protein  40.44 
 
 
319 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.944311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3489  Pirin-like  38.04 
 
 
307 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0435  pirin-related protein  39.13 
 
 
290 aa  179  4e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0566  Pirin domain protein  39.08 
 
 
307 aa  178  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.660641  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0588  putative pirin-like protein  40.2 
 
 
299 aa  178  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.927348  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0608  Pirin domain protein  38.38 
 
 
307 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.228088 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1596  Pirin domain protein  40.14 
 
 
301 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2913  Pirin-like  38.27 
 
 
296 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4923  Pirin domain protein  37.28 
 
 
310 aa  176  4e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695284  normal  0.690041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0744  hypothetical protein  39.71 
 
 
291 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738482  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2278  pirin domain-containing protein  39.43 
 
 
301 aa  176  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263885  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0517  pirin domain-containing protein  38.77 
 
 
293 aa  176  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.858026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0286  pirin-related protein  39.49 
 
 
306 aa  175  8e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0493  pirin domain-containing protein  38.79 
 
 
307 aa  174  1e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3218  Pirin domain protein  39.35 
 
 
291 aa  174  1e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1805  Pirin domain protein  36.96 
 
 
296 aa  175  1e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.5163  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0546  pirin domain-containing protein  37.19 
 
 
306 aa  174  2e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.266378  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1965  pirin domain-containing protein  37.18 
 
 
309 aa  174  2e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0444426  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04763  pirin, N-terminal:Pirin, C-terminal  39.19 
 
 
296 aa  172  7e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0233  Pirin domain protein  37.37 
 
 
289 aa  172  8e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2089  Pirin domain protein  36.96 
 
 
304 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0019  putative Pirin family protein  36.61 
 
 
305 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.495948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1918  pirin domain-containing protein  38.99 
 
 
297 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.883605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0734  Pirin-like  37.68 
 
 
306 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0009  Pirin-like  38.49 
 
 
306 aa  170  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00543202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3490  pirin domain-containing protein  34.42 
 
 
293 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.970505  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0149  Pirin-like  39.07 
 
 
305 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0561  Pirin domain protein  38.41 
 
 
305 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0589357  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0252  Pirin domain protein  37.37 
 
 
289 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.175941 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2897  Pirin-like  40.77 
 
 
294 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0346  Pirin-like  38.99 
 
 
305 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0377  putative pirin-like protein  38.01 
 
 
289 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3120  Pirin domain protein  38.46 
 
 
307 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.680161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2484  pirin domain-containing protein  38.63 
 
 
293 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0887266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02280  Pirin-related protein  36.92 
 
 
335 aa  167  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0703  Pirin-like protein  38.85 
 
 
305 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2092  Pirin domain protein  35.48 
 
 
311 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.909914  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1666  pirin-related protein  32.97 
 
 
290 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0486523  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2372  pirin domain-containing protein  34.59 
 
 
311 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.178763  normal  0.995053 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1367  pirin domain-containing protein  38.27 
 
 
293 aa  166  6e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0431465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1889  Pirin-like  35.03 
 
 
313 aa  165  7e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3696  Pirin domain protein  33.68 
 
 
300 aa  165  1e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.01108  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1954  Pirin-like  37.91 
 
 
293 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0828005  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0219  pirin  37.77 
 
 
306 aa  164  1e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2565  pirin domain-containing protein  37.91 
 
 
293 aa  164  1e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2613  pirin domain-containing protein  37.91 
 
 
293 aa  164  1e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4532  Pirin-like protein  38.27 
 
 
294 aa  164  2e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1266  pirin domain-containing protein  37.91 
 
 
294 aa  164  2e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5897  Pirin-like protein  37.05 
 
 
293 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867942  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1389  pirin domain-containing protein  38.13 
 
 
293 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.614726  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1300  pirin domain-containing protein  37.55 
 
 
294 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.937895  normal  0.0576323 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0907  Pirin-like  38.13 
 
 
293 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2983  Pirin domain protein  37.02 
 
 
287 aa  163  4e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.373808  normal  0.0595027 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2143  pirin domain-containing protein  35.14 
 
 
305 aa  162  5e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0640  pirin-related protein  36.98 
 
 
291 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.524638  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0720  hypothetical protein  36.23 
 
 
340 aa  162  8e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00526543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0128  Pirin domain protein  35.51 
 
 
312 aa  162  8e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.266704 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0185  pirin domain-containing protein  35.51 
 
 
312 aa  162  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>