180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0052 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56349e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  98.28 
 
 
232 aa  469  1e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70567e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  98.28 
 
 
232 aa  469  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  85.34 
 
 
232 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  8.27601e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  85.34 
 
 
232 aa  405  1e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  85.34 
 
 
232 aa  406  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  84.05 
 
 
232 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  78.88 
 
 
232 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  78.88 
 
 
232 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  69.23 
 
 
217 aa  323  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  65.09 
 
 
214 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  65.37 
 
 
217 aa  306  2e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27966e-09 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  40 
 
 
217 aa  171  8e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3550  hypothetical protein  35.53 
 
 
220 aa  143  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0375  K+ transporter  36.68 
 
 
220 aa  134  1e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.506643  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  35.71 
 
 
220 aa  128  9e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  44.27 
 
 
215 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  33.48 
 
 
223 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  32.6 
 
 
227 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  30.57 
 
 
221 aa  121  8e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  43.24 
 
 
221 aa  120  2e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  30.13 
 
 
221 aa  119  4e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  33.63 
 
 
213 aa  119  4e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  33.19 
 
 
222 aa  118  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  31.56 
 
 
224 aa  116  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  41.89 
 
 
221 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  31.28 
 
 
215 aa  115  7e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  37.42 
 
 
220 aa  114  1e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 
222 aa  114  1e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  31.84 
 
 
224 aa  114  1e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  38.89 
 
 
219 aa  114  1e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  30.28 
 
 
221 aa  113  2e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  41.22 
 
 
220 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  41.22 
 
 
220 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  27.11 
 
 
220 aa  112  4e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 
225 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 
224 aa  111  8e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  36.81 
 
 
220 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  40.91 
 
 
223 aa  110  1e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  28.76 
 
 
224 aa  110  1e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40.94 
 
 
220 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  31.11 
 
 
225 aa  109  4e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
218 aa  108  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  34.73 
 
 
231 aa  108  9e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  33.54 
 
 
217 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  30.94 
 
 
220 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  35.48 
 
 
219 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  26.96 
 
 
233 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  35 
 
 
224 aa  106  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  37.67 
 
 
230 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  32.12 
 
 
227 aa  104  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  31.95 
 
 
224 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  29 
 
 
217 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  30.97 
 
 
217 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  30.63 
 
 
220 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  31.14 
 
 
219 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  37.4 
 
 
217 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  31.28 
 
 
233 aa  101  9e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  32.73 
 
 
224 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  30.7 
 
 
222 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2522  TrkA domain-containing protein  37.98 
 
 
221 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000136868  normal  0.0316786 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  40.26 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  30.53 
 
 
229 aa  99.8  4e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  33.12 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  36.36 
 
 
231 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  29.82 
 
 
222 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  28 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  27.91 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1642  hypothetical protein  27.11 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  34.38 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  32.1 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  32.24 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  34.06 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  30.88 
 
 
232 aa  95.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  35.1 
 
 
218 aa  95.1  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  32.89 
 
 
222 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0439  putative potassium uptake protein TrkA  36.43 
 
 
216 aa  94.7  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1301  potassium uptake protein TrkA, putative  36.43 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  32.43 
 
 
221 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1476  potassium uptake protein TrkA, putative  36.43 
 
 
216 aa  94.4  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  28.66 
 
 
222 aa  93.6  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  32.7 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0137  TRK system potassium uptake protein TrkA, putative  38.28 
 
 
213 aa  92  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  32.7 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
223 aa  91.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  32.74 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  31.74 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  33.59 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0294  TrkA domain-containing protein  25.91 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>