237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0051 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0054  TrkH family potassium uptake protein  95.14 
 
 
453 aa  860  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.22698e-05 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001289  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  79.07 
 
 
454 aa  735  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0057  Trk family potassium uptake protein  90.73 
 
 
453 aa  827  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4282  potassium uptake protein KtrB  72.47 
 
 
454 aa  672  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0046  TrkH family potassium uptake protein  90.75 
 
 
454 aa  832  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0057  TrkH family potassium uptake protein  96.03 
 
 
453 aa  870  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.78373e-07 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0049  TrkH family potassium uptake protein  96.25 
 
 
453 aa  870  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4305  TrkH family potassium uptake protein  93.39 
 
 
454 aa  847  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0672228  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4481  TrkH family potassium uptake protein  72.97 
 
 
455 aa  661  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.0806e-09 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0053  potassium uptake protein, TrkH family  92.95 
 
 
454 aa  844  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0051  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
453 aa  896  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43033e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0049  TrkH family potassium uptake protein  96.03 
 
 
453 aa  871  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330667 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0749  TrkH family potassium uptake protein  50.79 
 
 
441 aa  446  1e-124  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.313509 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1115  TrkH family potassium uptake protein  47.1 
 
 
447 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0376  cation transport protein  47.1 
 
 
439 aa  401  1e-110  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3901  potassium uptake protein, TrkH family  46.28 
 
 
447 aa  397  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1312  TrkH family potassium uptake protein  46.51 
 
 
447 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.03643  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1442  potassium uptake protein, TrkH family  46.28 
 
 
447 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1275  potassium/sodium uptake protein  46.06 
 
 
447 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1274  potassium/sodium uptake protein  46.06 
 
 
447 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3549  K+ transporter Trk  48.61 
 
 
449 aa  389  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.840794  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1480  potassium uptake protein, TrkH family  45.83 
 
 
447 aa  390  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1409  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 
447 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.49277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1509  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 
447 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1548  potassium uptake protein, TrkH family  45.6 
 
 
447 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0388885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1301  TrkH family potassium uptake protein  45.83 
 
 
447 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0881391  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3982  potassium uptake protein, TrkH family  45.24 
 
 
439 aa  357  2e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1362  potassium uptake protein, TrkH family  45.48 
 
 
439 aa  358  2e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.883296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1203  cation transporter  44.55 
 
 
439 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.790551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1423  TrkH family potassium uptake protein  44.32 
 
 
439 aa  351  2e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1225  TrkH family potassium uptake protein  44.78 
 
 
439 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.718328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1399  potassium uptake protein, TrkH family  44.32 
 
 
439 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1323  TrkH family potassium uptake protein  44.32 
 
 
439 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1201  cation transporter  44.32 
 
 
439 aa  349  5e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1224  TrkH family potassium uptake protein  44.08 
 
 
439 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1488  K+ transporter Trk  46.29 
 
 
453 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1037  TrkH family potassium uptake protein  43.62 
 
 
439 aa  343  3e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146152  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1464  potassium uptake protein, TrkH family  44.29 
 
 
420 aa  340  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01408  potassium uptake protein  41.58 
 
 
455 aa  335  8e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0140  TrkH family potassium uptake protein  43.71 
 
 
447 aa  333  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.06231e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1067  potassium uptake protein, TrkH family  43.69 
 
 
445 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004054  potassium uptake protein integral membrane component KtrB  42.01 
 
 
455 aa  323  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0408977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1755  K+ transporter Trk  42.86 
 
 
443 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000259228  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0103  potassium uptake protein, TrkH family  44.16 
 
 
443 aa  321  2e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  2.78363e-12  decreased coverage  8.77762e-18 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0459  potassium uptake protein KtrB  42.07 
 
 
454 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11700  potassium uptake protein, TrkH family  39.95 
 
 
441 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00105837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0431  potassium uptake protein, TrkH family  41.28 
 
 
446 aa  308  1e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.54787e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0695  Na+-transporting ATP synthase  43.58 
 
 
471 aa  308  1e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.33945e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1616  TrkH family potassium uptake protein  43.85 
 
 
444 aa  308  1e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  3.8325e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11710  potassium uptake protein, TrkH family  37.64 
 
 
446 aa  290  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.13719e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1584  potassium uptake protein, TrkH family  39.31 
 
 
446 aa  287  3e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.91225e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0545  TrkH family potassium uptake protein  40.48 
 
 
458 aa  273  5e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0338  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.69 
 
 
456 aa  267  3e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.029372  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1044  hypothetical protein  39.36 
 
 
447 aa  267  3e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1512  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.67 
 
 
454 aa  263  7e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112909 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1658  TrkH family potassium uptake protein  38.85 
 
 
450 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.552595  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1583  K+ transporter Trk  37.61 
 
 
458 aa  259  8e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0013  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.13 
 
 
442 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3883  TrkH family potassium uptake protein  36.18 
 
 
443 aa  256  7e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00920835 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0121  potassium uptake protein, TrkH family  37.76 
 
 
449 aa  256  8e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  2.17077e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0268  potassium uptake protein, TrkH family  38.03 
 
 
456 aa  254  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2102  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.86 
 
 
435 aa  253  4e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0464809  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2065  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.86 
 
 
435 aa  253  4e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1080  K+ transporter Trk  36.99 
 
 
447 aa  250  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0086  TrkH family potassium uptake protein  34.08 
 
 
457 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.29525e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2143  TrkH family potassium uptake protein  38.8 
 
 
446 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00831138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0415  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.38 
 
 
455 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  1.97091e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1855  TrkH family potassium uptake protein  38.8 
 
 
446 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000925763  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36680  Trk-type K+ transport system, membrane component  36.28 
 
 
432 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0226532  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2080  potassium uptake protein, TrkH family  35.59 
 
 
447 aa  244  2e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  1.61963e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3602  cation transporter  37.05 
 
 
457 aa  243  6e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1300  TrkH family potassium uptake protein  36.78 
 
 
447 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1475  TrkH family potassium uptake protein  36.78 
 
 
447 aa  239  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0441  TrkH family potassium uptake protein  36.78 
 
 
447 aa  238  2e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0248  potassium uptake protein, TrkH family  35.14 
 
 
451 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000139888  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1511  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.9 
 
 
452 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14850  potassium uptake protein, TrkH family  38.52 
 
 
431 aa  234  2e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.599997  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3556  H(+)-transporting two-sector ATPase  35.9 
 
 
453 aa  233  5e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2302  putative cation transporter  34.9 
 
 
469 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0138  TRK system potassium uptake protein TrkB, putative  35.02 
 
 
447 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3464  potassium uptake protein, TrkH family  35.99 
 
 
444 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5257  potassium uptake protein, TrkH family  35.68 
 
 
443 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0320519  normal  0.460261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1710  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.05 
 
 
449 aa  230  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.438668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0065  Trk-type K+ transport systems, membrane component  33.26 
 
 
467 aa  229  1e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1634  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.14 
 
 
479 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717149  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3973  sodium transporter family protein  35.35 
 
 
449 aa  227  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2829  potassium uptake protein, TrkH family  35.49 
 
 
453 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0462619 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1234  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.68 
 
 
449 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1558  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.41 
 
 
447 aa  225  1e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.206556  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1352  H(+)-transporting two-sector ATPase  33.69 
 
 
448 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2842  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.56 
 
 
446 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115847  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0524  H(+)-transporting two-sector ATPase  32.8 
 
 
473 aa  224  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0215  cation transporter  36.12 
 
 
443 aa  223  4e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4696  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.24 
 
 
452 aa  223  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1045  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.49 
 
 
449 aa  221  1e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0138  potassium uptake protein, TrkH family  39.52 
 
 
474 aa  222  1e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0312  TrkH family potassium uptake protein  34.89 
 
 
574 aa  222  1e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00568204  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4053  potassium uptake protein, TrkH family  34.58 
 
 
454 aa  219  8e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4092  potassium uptake protein, TrkH family  34.58 
 
 
454 aa  219  8e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.407165  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4246  H(+)-transporting two-sector ATPase  39.34 
 
 
450 aa  219  8e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.453683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>