174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0047 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0053  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 
161 aa  327  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.17006e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0047  preprotein translocase subunit SecB  100 
 
 
161 aa  327  6e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.28873e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0045  preprotein translocase subunit SecB  99.38 
 
 
161 aa  325  1e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0042  preprotein translocase subunit SecB  98.14 
 
 
161 aa  323  8e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0049  preprotein translocase subunit SecB  97.3 
 
 
161 aa  300  7e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0049  preprotein translocase subunit SecB  97.3 
 
 
161 aa  300  7e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.26595e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  97.3 
 
 
161 aa  300  7e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4330  preprotein translocase subunit SecB  96.62 
 
 
161 aa  297  3e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0062  preprotein translocase subunit SecB  88.2 
 
 
159 aa  291  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0052  preprotein translocase subunit SecB  99.29 
 
 
157 aa  288  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4215  preprotein translocase subunit SecB  91.89 
 
 
161 aa  286  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4468  preprotein translocase subunit SecB  91.89 
 
 
162 aa  283  6e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  89.19 
 
 
157 aa  280  6e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4875  preprotein translocase subunit SecB  91.22 
 
 
163 aa  280  6e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  90.97 
 
 
162 aa  276  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3696  preprotein translocase subunit SecB  90.85 
 
 
164 aa  266  8e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3981  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 
155 aa  223  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.572141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4026  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 
155 aa  223  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3919  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 
155 aa  223  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4087  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 
155 aa  223  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3900  preprotein translocase subunit SecB  74.65 
 
 
155 aa  223  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.192717 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  72.79 
 
 
155 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.738209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  67.31 
 
 
158 aa  222  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 
155 aa  222  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  71.43 
 
 
155 aa  221  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  67.53 
 
 
156 aa  220  6e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3940  preprotein translocase subunit SecB  70.95 
 
 
179 aa  220  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4816  preprotein translocase subunit SecB  73.24 
 
 
156 aa  219  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348641  hitchhiker  0.000175665 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4388  preprotein translocase, SecB subunit  70.07 
 
 
165 aa  220  8e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0179  preprotein translocase subunit SecB  72.14 
 
 
158 aa  219  1e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  72.54 
 
 
158 aa  218  2e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  72.54 
 
 
158 aa  218  2e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  72.54 
 
 
158 aa  218  2e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3614  preprotein translocase subunit SecB  70.29 
 
 
169 aa  214  3e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2802  preprotein translocase subunit SecB  68.03 
 
 
160 aa  211  5e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.221932  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  65.07 
 
 
169 aa  208  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  66.44 
 
 
155 aa  207  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.191942 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002245  chaperone protein SecB  68.75 
 
 
154 aa  205  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.725619  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2227  preprotein translocase subunit SecB  73.08 
 
 
154 aa  204  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0081632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00123  preprotein translocase subunit SecB  67.36 
 
 
161 aa  204  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  58.94 
 
 
162 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  60.14 
 
 
164 aa  196  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4243  preprotein translocase subunit SecB  58.13 
 
 
161 aa  194  4e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.129397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  56.86 
 
 
161 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5053  preprotein translocase subunit SecB  57.33 
 
 
161 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4926  preprotein translocase subunit SecB  57.33 
 
 
161 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183537  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5104  preprotein translocase subunit SecB  56 
 
 
161 aa  189  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3164  preprotein translocase subunit SecB  56.94 
 
 
165 aa  187  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67720  preprotein translocase subunit SecB  55.06 
 
 
163 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  3.56209e-05  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5862  preprotein translocase subunit SecB  55.06 
 
 
163 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  55.33 
 
 
161 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  58.7 
 
 
171 aa  183  1e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0715  protein-export protein SecB  53.06 
 
 
159 aa  181  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  57.42 
 
 
162 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  57.42 
 
 
162 aa  175  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  53.16 
 
 
163 aa  173  1e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  51.92 
 
 
164 aa  172  1e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  54.11 
 
 
148 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  1.44211e-12  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  56.25 
 
 
164 aa  162  2e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  56.15 
 
 
150 aa  160  5e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  54.48 
 
 
155 aa  159  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  50.71 
 
 
149 aa  156  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  7.05897e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  46.75 
 
 
173 aa  156  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2571  preprotein translocase subunit SecB  50.32 
 
 
188 aa  154  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  48.73 
 
 
168 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  47.71 
 
 
178 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  55.38 
 
 
151 aa  150  9e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  48.39 
 
 
164 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  50.34 
 
 
161 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  50.34 
 
 
161 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  48.91 
 
 
172 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  48.91 
 
 
172 aa  147  6e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  46.9 
 
 
171 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  45.39 
 
 
159 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  42.07 
 
 
172 aa  141  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  47.26 
 
 
152 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  46.48 
 
 
160 aa  133  1e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  43.26 
 
 
156 aa  133  1e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
163 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
164 aa  131  4e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
164 aa  131  4e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
164 aa  131  4e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  41.72 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
159 aa  131  4e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  42.55 
 
 
156 aa  131  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  46.43 
 
 
160 aa  130  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  43.51 
 
 
157 aa  130  7e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>