16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0044 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  89.49 
 
 
1035 bp  1174  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  83.64 
 
 
1089 bp  733  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  83.09 
 
 
1089 bp  686  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  83.09 
 
 
1089 bp  686  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  83.09 
 
 
1089 bp  686  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  97.62 
 
 
1134 bp  2026  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  98.15 
 
 
1134 bp  2074  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0044    100 
 
 
1133 bp  2246  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  81.54 
 
 
1134 bp  577  1e-162  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  92.77 
 
 
1134 bp  117  7e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  94.59 
 
 
1086 bp  115  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  92.68 
 
 
1137 bp  115  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  92.21 
 
 
1134 bp  105  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  1.59575e-05 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  80.73 
 
 
1137 bp  99.6  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  85.26 
 
 
1140 bp  77.8  6e-12  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  82.56 
 
 
1134 bp  52  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>