More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0039 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0039  carbonic anhydrase  100 
 
 
182 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000072443  hitchhiker  0.000629469 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0037  carbonic anhydrase  99.45 
 
 
182 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000433363  hitchhiker  0.00243914 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0045  carbonic anhydrase  97.25 
 
 
182 aa  357  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000141842  hitchhiker  0.0000010839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0042  carbonic anhydrase  96.7 
 
 
182 aa  357  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0042  carbonic anhydrase  93.89 
 
 
182 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000454133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0037  carbonic anhydrase  93.89 
 
 
182 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198121  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0034  carbonic anhydrase  93.89 
 
 
182 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000602369  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0041  carbonic anhydrase, family 3  93.89 
 
 
182 aa  341  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000508164  unclonable  0.00000000000448586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0041  carbonic anhydrase  93.33 
 
 
182 aa  340  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000411727  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3725  carbonic anhydrase  82.58 
 
 
185 aa  314  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00601402  hitchhiker  0.00871836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0037  carbonic anhydrase  80.56 
 
 
181 aa  304  5.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000544891  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0045  carbonic anhydrase  81.36 
 
 
184 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000362772  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0042  carbonic anhydrase  82.49 
 
 
185 aa  301  3.0000000000000004e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000058127  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0036  carbonic anhydrase  79.21 
 
 
184 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906421  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0054  carbonic anhydrase  79.78 
 
 
182 aa  298  3e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00000373213  normal  0.14059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0049  carbonic anhydrase  80.9 
 
 
180 aa  288  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00044877  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002069  carbonic anhydrase family 3  68.97 
 
 
182 aa  260  8e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000548613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2463  carbonic anhydrase  67.42 
 
 
184 aa  260  8.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000149932  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0033  carbonic anhydrase/acetyltransferase  68.39 
 
 
177 aa  259  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000120925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00380  hypothetical protein  69.54 
 
 
183 aa  257  5.0000000000000005e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0032  transferase hexapeptide domain-containing protein  66.86 
 
 
179 aa  254  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00032  putative carbonic anhydrase/acetyltransferase  60.67 
 
 
180 aa  248  4e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00477036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01130  Trimeric LpxA-like superfamily protein  66.09 
 
 
192 aa  248  5e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339277  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4505  putative transferase  65.17 
 
 
180 aa  247  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187962  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  64.04 
 
 
178 aa  244  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3782  putative transferase  63.28 
 
 
182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00339373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0030  anhydrase family 3 protein  62.71 
 
 
185 aa  242  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0233  carbonic anhydrase  64.94 
 
 
179 aa  241  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00386498  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  61.49 
 
 
180 aa  240  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3961  putative transferase  62.71 
 
 
182 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000707478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  62.07 
 
 
180 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3711  putative transferase  63.79 
 
 
184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000368449  normal  0.0573377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0085  putative transferase  60.67 
 
 
181 aa  238  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000367586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0322  hexapaptide repeat-containing transferase  63.33 
 
 
180 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000287366  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3876  hypothetical protein  63.33 
 
 
180 aa  236  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000917644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0623  hypothetical protein  63.33 
 
 
180 aa  236  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000022748  normal  0.0528522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0319  hexapaptide repeat-containing transferase  59.2 
 
 
179 aa  235  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0044  hexapaptide repeat-containing transferase  59.77 
 
 
181 aa  234  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0145  hypothetical protein  59.2 
 
 
181 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3763  hypothetical protein  60.11 
 
 
293 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000274593  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0446  putative transferase  61.24 
 
 
178 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000031956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3665  hypothetical protein  60.11 
 
 
256 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000398302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3473  hypothetical protein  60.11 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  6.93281e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0434  putative transferase  60.11 
 
 
184 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000121267  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4603  hypothetical protein  60.11 
 
 
184 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254067  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0434  putative transferase  60.11 
 
 
184 aa  230  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.00000000608739  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4460  carbonic anhydrase  59.2 
 
 
180 aa  229  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0053  anhydrase family 3 protein  58.14 
 
 
179 aa  229  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.389701  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3576  hypothetical protein  59.55 
 
 
184 aa  228  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128421  normal  0.244838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03130  hypothetical protein  59.55 
 
 
184 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000042792  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03081  hypothetical protein  59.55 
 
 
184 aa  228  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000850407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  59.2 
 
 
182 aa  227  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0401  anhydrase family 3 protein  56.82 
 
 
179 aa  226  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  59.2 
 
 
181 aa  223  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0095  anhydrase family 3 protein  57.22 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425892 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2797  carbonic anhydrase  58.05 
 
 
180 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0110  carbonic anhydrase  57.22 
 
 
182 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0110  transferase  57.22 
 
 
182 aa  220  8e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  54.07 
 
 
180 aa  210  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1122  putative transferase  51.41 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000279572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  54.97 
 
 
176 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0613  hypothetical protein  47.46 
 
 
177 aa  194  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0629  hypothetical protein  47.46 
 
 
178 aa  193  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0126  transferase hexapeptide repeat containing protein  49.12 
 
 
185 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.98983  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3842  transferase  52 
 
 
176 aa  191  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0151  hexapaptide repeat-containing transferase  50.29 
 
 
179 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.240687  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0106  carbonic anhydrase family 3  50 
 
 
187 aa  184  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  46.29 
 
 
183 aa  184  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  48.54 
 
 
176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2432  carbonic anhydrase  48.31 
 
 
189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03943  transferase  47.73 
 
 
181 aa  180  9.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  50 
 
 
175 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  50 
 
 
175 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0223  hypothetical protein  49.13 
 
 
169 aa  177  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  49.43 
 
 
175 aa  177  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0870  transferase  45.98 
 
 
187 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0989  transferase  45.98 
 
 
187 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  45.98 
 
 
174 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  46.55 
 
 
179 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  44.75 
 
 
182 aa  167  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  44.2 
 
 
182 aa  167  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  44.2 
 
 
182 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  44.19 
 
 
177 aa  165  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.83 
 
 
177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  47.06 
 
 
175 aa  162  3e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  44.25 
 
 
177 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2420  hexapaptide repeat-containing transferase  44.19 
 
 
189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.993987  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  43.68 
 
 
186 aa  161  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  44.77 
 
 
177 aa  159  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  44.77 
 
 
175 aa  157  9e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1087  carbonic anhydrase  42.13 
 
 
182 aa  156  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.862883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  43.82 
 
 
189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0249  acetyltransferase  45.61 
 
 
177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0858  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 
172 aa  150  8.999999999999999e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  49.69 
 
 
175 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  42.51 
 
 
185 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  44.17 
 
 
170 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2541  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  44.57 
 
 
171 aa  147  6e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1936  acetyltransferase, CysE/LacA/LpxA/NodL family  45.83 
 
 
177 aa  147  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1066  hexapeptide transferase family protein  37.65 
 
 
170 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>