209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0035 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0033  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
302 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.011595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0035  coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
302 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132201  hitchhiker  0.00964681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0041  coproporphyrinogen III oxidase  99.01 
 
 
302 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0219573  hitchhiker  5.53459e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0038  coproporphyrinogen III oxidase  96.36 
 
 
302 aa  610  1e-174  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0037  coproporphyrinogen III oxidase  93.05 
 
 
323 aa  598  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.430398  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0037  coproporphyrinogen III oxidase  93.05 
 
 
302 aa  594  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49114e-08 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0033  coproporphyrinogen III oxidase  93.05 
 
 
302 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0038  coproporphyrinogen III oxidase  93.05 
 
 
302 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.893663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0030  coproporphyrinogen III oxidase  92.38 
 
 
302 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.378098  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0045  coproporphyrinogen III oxidase  86.42 
 
 
306 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.178865  normal  0.253632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3729  coproporphyrinogen III oxidase  87.63 
 
 
303 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.186137  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0038  coproporphyrinogen III oxidase  85.76 
 
 
304 aa  552  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0042  coproporphyrinogen III oxidase  85.43 
 
 
306 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0059194  normal  0.559288 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0050  coproporphyrinogen III oxidase  84.77 
 
 
304 aa  547  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646189  normal  0.257858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0030  coproporphyrinogen III oxidase  83.33 
 
 
310 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210418  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0030  coproporphyrinogen III oxidase  82.12 
 
 
305 aa  530  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000103554  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00383  coproporphyrinogen III oxidase  72.79 
 
 
305 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002066  coproporphyrinogen III oxidase aerobic  72.46 
 
 
305 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.358636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1243  coproporphyrinogen III oxidase  75.59 
 
 
299 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0025  coproporphyrinogen III oxidase  71.19 
 
 
303 aa  472  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2573  coproporphyrinogen III oxidase  75.59 
 
 
299 aa  471  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1225  Coproporphyrinogen oxidase  75.59 
 
 
299 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00028  coproporphyrinogen III oxidase  76.11 
 
 
310 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14394  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2711  coproporphyrinogen III oxidase  76.25 
 
 
299 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2687  coproporphyrinogen III oxidase  76.25 
 
 
299 aa  469  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.143173  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02336  coproporphyrinogen III oxidase  75.25 
 
 
299 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2596  coproporphyrinogen III oxidase  75.59 
 
 
299 aa  469  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2817  coproporphyrinogen III oxidase  75.59 
 
 
299 aa  469  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.56731  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2645  coproporphyrinogen III oxidase  75.59 
 
 
299 aa  469  1e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3290  Coproporphyrinogen oxidase  72.85 
 
 
312 aa  469  1e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02298  hypothetical protein  75.25 
 
 
299 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0116  coproporphyrinogen III oxidase  73.47 
 
 
304 aa  466  1e-130  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.998466  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2722  coproporphyrinogen III oxidase  74.92 
 
 
299 aa  467  1e-130  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2808  coproporphyrinogen III oxidase  74.58 
 
 
299 aa  464  1e-130  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3464  coproporphyrinogen III oxidase  72.85 
 
 
306 aa  467  1e-130  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0029  coproporphyrinogen III oxidase  72 
 
 
307 aa  464  1e-130  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2791  coproporphyrinogen III oxidase  69.87 
 
 
304 aa  464  1e-130  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2591  coproporphyrinogen III oxidase  74.58 
 
 
299 aa  466  1e-130  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3211  Coproporphyrinogen oxidase  72.52 
 
 
311 aa  466  1e-130  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2784  coproporphyrinogen III oxidase  70.86 
 
 
309 aa  461  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00390735 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1393  coproporphyrinogen III oxidase  70.86 
 
 
309 aa  461  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.586678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2465  coproporphyrinogen III oxidase  70.72 
 
 
305 aa  461  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00683566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0757  coproporphyrinogen III oxidase  71.33 
 
 
310 aa  461  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2824  coproporphyrinogen III oxidase  69.23 
 
 
317 aa  462  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000193561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2279  Coproporphyrinogen oxidase  71.43 
 
 
309 aa  457  1e-128  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.0202052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2957  coproporphyrinogen III oxidase  71.91 
 
 
299 aa  457  1e-128  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.929595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1280  coproporphyrinogen III oxidase  70.53 
 
 
309 aa  459  1e-128  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3666  coproporphyrinogen III oxidase  74.92 
 
 
299 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.936359  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0993  coproporphyrinogen III oxidase  70.81 
 
 
310 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1223  coproporphyrinogen III oxidase  65.99 
 
 
309 aa  441  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3996  coproporphyrinogen III oxidase  67.11 
 
 
312 aa  438  1e-122  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.218154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2863  coproporphyrinogen III oxidase  67.22 
 
 
307 aa  440  1e-122  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1223  coproporphyrinogen III oxidase  65.99 
 
 
311 aa  438  1e-122  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0047  coproporphyrinogen III oxidase  68.23 
 
 
308 aa  432  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2696  coproporphyrinogen III oxidase  62.58 
 
 
333 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0480626  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0025  coproporphyrinogen III oxidase  66.22 
 
 
305 aa  427  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3938  coproporphyrinogen III oxidase  69.39 
 
 
298 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537037  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00280  coproporphyrinogen III oxidase  66.22 
 
 
305 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.477574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0060  coproporphyrinogen III oxidase  67.12 
 
 
304 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0017  coproporphyrinogen III oxidase  66.89 
 
 
323 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3669  coproporphyrinogen III oxidase  66.44 
 
 
298 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00220  coproporphyrinogen III oxidase  67.46 
 
 
309 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.333342  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0170  coproporphyrinogen III oxidase, aerobic  66.44 
 
 
304 aa  423  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03935  coproporphyrinogen III oxidase  68.71 
 
 
299 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0022  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 
304 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449808  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2092  Coproporphyrinogen oxidase  64.82 
 
 
313 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0593493  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0024  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 
304 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0073  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 
303 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.188544  hitchhiker  0.000371882 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0089  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 
303 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0092  coproporphyrinogen III oxidase  64.75 
 
 
303 aa  416  1e-115  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.469648  hitchhiker  2.33392e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0089  coproporphyrinogen III oxidase  65.42 
 
 
303 aa  417  1e-115  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.554189  hitchhiker  1.35583e-11 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2634  coproporphyrinogen III oxidase  66.56 
 
 
304 aa  413  1e-114  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0385786  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0409  coproporphyrinogen III oxidase  60.52 
 
 
332 aa  405  1e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0203114 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5623  coproporphyrinogen III oxidase  62.62 
 
 
307 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2461  coproporphyrinogen III oxidase  62.91 
 
 
303 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0135  coproporphyrinogen III oxidase  63.64 
 
 
299 aa  401  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1684  coproporphyrinogen III oxidase  62.95 
 
 
323 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254442  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2296  coproporphyrinogen III oxidase  62.95 
 
 
323 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643346  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0017  coproporphyrinogen III oxidase  63.33 
 
 
305 aa  400  1e-110  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0015  coproporphyrinogen III oxidase  64.29 
 
 
331 aa  400  1e-110  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.91658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2319  coproporphyrinogen III oxidase  62.95 
 
 
307 aa  400  1e-110  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0346  coproporphyrinogen III oxidase  60.07 
 
 
302 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0219  coproporphyrinogen III oxidase  60.32 
 
 
336 aa  392  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0901124 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0243  coproporphyrinogen III oxidase  60.32 
 
 
336 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.571977  normal  0.975295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0982  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 
307 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0313583  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1441  coproporphyrinogen III oxidase  64.9 
 
 
302 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.545118  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2320  coproporphyrinogen III oxidase  61.26 
 
 
306 aa  389  1e-107  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.216124  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2066  coproporphyrinogen III oxidase  59.93 
 
 
310 aa  388  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87254  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1990  coproporphyrinogen III oxidase  60.26 
 
 
302 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0815567  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0783  coproporphyrinogen III oxidase  61.59 
 
 
303 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00696662  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2524  coproporphyrinogen III oxidase  61.59 
 
 
303 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2334  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 
306 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193122  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0273  coproporphyrinogen III oxidase  60.81 
 
 
316 aa  388  1e-107  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2213  coproporphyrinogen III oxidase  61.64 
 
 
306 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2192  coproporphyrinogen III oxidase  60.93 
 
 
302 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1299  coproporphyrinogen III oxidase  60.26 
 
 
307 aa  387  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0514179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1383  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 
326 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.461453  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1073  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 
307 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.828058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1886  coproporphyrinogen III oxidase  60 
 
 
307 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.668105  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3261  coproporphyrinogen III oxidase  59.6 
 
 
307 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.77176  normal  0.974311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>