72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0032 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0030  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  319  1e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0851581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0032  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  319  1e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.263953  hitchhiker  0.00416166 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0035  smg protein  99.37 
 
 
158 aa  318  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0038  hypothetical protein  99.37 
 
 
158 aa  317  4e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.272353  hitchhiker  4.78432e-06 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0034  protein of unknown function DUF494  96.84 
 
 
157 aa  306  1e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.45632e-07 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0027  hypothetical protein  96.84 
 
 
157 aa  306  1e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0030  hypothetical protein  96.84 
 
 
157 aa  306  1e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0035  hypothetical protein  96.84 
 
 
157 aa  306  1e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0034  hypothetical protein  96.84 
 
 
157 aa  306  1e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0038  hypothetical protein  89.24 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0240972  normal  0.0588054 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3733  hypothetical protein  89.87 
 
 
157 aa  289  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0219061  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0041  hypothetical protein  87.97 
 
 
157 aa  287  5e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.479355 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0034  hypothetical protein  87.34 
 
 
157 aa  282  1e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0027  hypothetical protein  87.34 
 
 
157 aa  282  1e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0027  hypothetical protein  87.34 
 
 
157 aa  281  2e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0046  hypothetical protein  72.67 
 
 
159 aa  238  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.249681  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00025  smg protein  69.18 
 
 
158 aa  216  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0026  hypothetical protein  68.12 
 
 
158 aa  209  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4509  hypothetical protein  63.92 
 
 
157 aa  204  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000588298  hitchhiker  0.000163466 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0441  hypothetical protein  63.69 
 
 
156 aa  204  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0817178  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0358  hypothetical protein  66.67 
 
 
157 aa  201  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0362316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0023  smg protein  65.82 
 
 
157 aa  201  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3966  hypothetical protein  62.67 
 
 
157 aa  197  4e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3880  hypothetical protein  60.13 
 
 
157 aa  194  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000155024  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0619  hypothetical protein  60.13 
 
 
157 aa  194  5e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000133668  normal  0.0223362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3787  hypothetical protein  62.67 
 
 
157 aa  194  5e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00193102  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0318  hypothetical protein  60.13 
 
 
157 aa  194  5e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0553382  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3716  hypothetical protein  62.66 
 
 
157 aa  192  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00195786  hitchhiker  0.0087907 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3767  hypothetical protein  62.66 
 
 
157 aa  190  7e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000724852  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4607  hypothetical protein  62.66 
 
 
157 aa  190  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0145872  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3580  hypothetical protein  62.66 
 
 
157 aa  190  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0216587  normal  0.15109 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0429  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  189  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.5196e-05  hitchhiker  0.000953721 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3478  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  189  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.37993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03086  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03135  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  189  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0891254  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0429  protein of unknown function DUF494  62.03 
 
 
157 aa  189  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0295235  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3673  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3708  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0588951  normal  0.0775927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3771  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3601  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.967939  normal  0.75952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3600  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  188  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.4697e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3669  hypothetical protein  62.03 
 
 
157 aa  188  3e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00596599  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00388  hypothetical protein  60.38 
 
 
159 aa  184  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0078  hypothetical protein  57.59 
 
 
157 aa  182  2e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002060  hypothetical protein  60.38 
 
 
159 aa  181  5e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2470  hypothetical protein  59.49 
 
 
158 aa  179  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3011  hypothetical protein  56.67 
 
 
159 aa  154  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2840  hypothetical protein  50 
 
 
155 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0192  hypothetical protein  47.71 
 
 
158 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2631  hypothetical protein  47.02 
 
 
157 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1932  hypothetical protein  48.03 
 
 
157 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1868  hypothetical protein  48.03 
 
 
157 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2325  hypothetical protein  46.36 
 
 
156 aa  132  1e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.801617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04052  hypothetical protein  48.7 
 
 
157 aa  131  4e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3588  hypothetical protein  47.4 
 
 
157 aa  126  1e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0075  hypothetical protein  42.5 
 
 
157 aa  125  2e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2276  protein of unknown function DUF494  44.59 
 
 
161 aa  116  1e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00580971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2089  protein of unknown function DUF494  40.88 
 
 
166 aa  115  2e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.596862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0087  hypothetical protein  38.31 
 
 
158 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.55352e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0190  hypothetical protein  40.15 
 
 
150 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2099  smg protein  37.66 
 
 
159 aa  101  5e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000321038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0098  protein of unknown function DUF494  42.86 
 
 
156 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0347  hypothetical protein  38.64 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0637077 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0280  hypothetical protein  39.39 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0612499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3863  hypothetical protein  33.11 
 
 
170 aa  84  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3882  hypothetical protein  34 
 
 
171 aa  83.6  9e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4642  hypothetical protein  33.11 
 
 
172 aa  80.1  1e-14  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.196493  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5116  protein of unknown function DUF494  30.41 
 
 
172 aa  73.2  1e-12  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0011  Smg protein  31.85 
 
 
148 aa  70.9  6e-12  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0017  protein of unknown function DUF494  37.5 
 
 
146 aa  65.5  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.640555  normal  0.0565587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0016  smg family protein  37.5 
 
 
146 aa  65.5  3e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0407  hypothetical protein  27.07 
 
 
161 aa  57  1e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.67933e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>