More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0019 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_0020  proline dipeptidase  76.94 
 
 
440 aa  720  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00930691  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0014  proline dipeptidase  76.48 
 
 
439 aa  729  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0021  proline dipeptidase  94.08 
 
 
440 aa  869  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215078  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0025  proline dipeptidase  99.32 
 
 
439 aa  909  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  4.09434e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0033  proline dipeptidase  75.8 
 
 
439 aa  707  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.12189  normal  0.0842725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0014  proline dipeptidase  94.53 
 
 
440 aa  869  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.258964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0022  proline dipeptidase  93.85 
 
 
440 aa  867  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0718408  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0022  proline dipeptidase  95.9 
 
 
439 aa  885  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0022  proline dipeptidase  77.85 
 
 
439 aa  740  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.324765  hitchhiker  0.00118901 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0019  proline dipeptidase  73.74 
 
 
440 aa  697  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0017  proline dipeptidase  99.09 
 
 
439 aa  907  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.767781  normal  0.0779588 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0017  proline dipeptidase  94.53 
 
 
440 aa  872  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.173112  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0021  proline dipeptidase  94.31 
 
 
440 aa  870  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.47485e-06 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0016  proline dipeptidase  79 
 
 
440 aa  749  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.98827  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0024  proline dipeptidase  79.45 
 
 
439 aa  753  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.840072  normal  0.0225878 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0019  proline dipeptidase  100 
 
 
439 aa  915  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0806227  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0013  proline dipeptidase  56.65 
 
 
443 aa  541  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0199  proline dipeptidase  57.24 
 
 
443 aa  518  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03734  proline dipeptidase  57.01 
 
 
448 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0263  proline dipeptidase  51.47 
 
 
443 aa  478  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00615185  normal  0.0316528 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3900  proline dipeptidase  53.27 
 
 
443 aa  481  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.022198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3746  proline dipeptidase  52.6 
 
 
443 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0139114  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4233  proline dipeptidase  51.47 
 
 
443 aa  475  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.118401  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4043  proline dipeptidase  51.69 
 
 
443 aa  472  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.144286  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3932  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  469  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0284  proline dipeptidase  50.34 
 
 
443 aa  469  1e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.82682e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1913  proline dipeptidase  50.11 
 
 
443 aa  468  1e-130  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0137948  normal  0.0277892 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03738  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  453  1e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24078  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4070  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  453  1e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000225581  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3948  proline dipeptidase  49.44 
 
 
443 aa  452  1e-126  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34685  normal  0.023319 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4134  peptidase M24  49.66 
 
 
443 aa  453  1e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.689702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03687  hypothetical protein  49.66 
 
 
443 aa  453  1e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4366  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  453  1e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000311805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4228  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  454  1e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000144079  normal  0.0133545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4163  proline dipeptidase  49.66 
 
 
443 aa  453  1e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.215567  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5286  proline dipeptidase  49.44 
 
 
443 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0321906  normal  0.0291317 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4317  proline dipeptidase  49.44 
 
 
443 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00026447  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4191  proline dipeptidase  48.32 
 
 
443 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4370  proline dipeptidase  48.32 
 
 
443 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4214  proline dipeptidase  48.32 
 
 
443 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0112386  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4263  proline dipeptidase  48.32 
 
 
443 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4310  proline dipeptidase  48.32 
 
 
443 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.554834 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02375  proline dipeptidase  46.87 
 
 
492 aa  406  1e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3276  proline dipeptidase  46.05 
 
 
443 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0455  proline dipeptidase  41.12 
 
 
429 aa  293  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3908  proline dipeptidase  36.92 
 
 
433 aa  276  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5810  peptidase M24  37.5 
 
 
470 aa  269  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174422  normal  0.924426 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  30.11 
 
 
465 aa  165  1e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  28.76 
 
 
429 aa  141  2e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  28.8 
 
 
443 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  32.75 
 
 
475 aa  139  9e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  28.44 
 
 
469 aa  137  3e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  28.05 
 
 
490 aa  137  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  28.38 
 
 
454 aa  136  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  26.65 
 
 
439 aa  132  2e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  33.44 
 
 
464 aa  130  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  28.17 
 
 
439 aa  129  1e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_29983  predicted protein  30.4 
 
 
524 aa  129  1e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  29.32 
 
 
442 aa  127  5e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  28.38 
 
 
433 aa  127  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  31.94 
 
 
452 aa  126  6e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  29.1 
 
 
442 aa  126  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  27.91 
 
 
446 aa  126  8e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  29 
 
 
461 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  28.01 
 
 
437 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  28.01 
 
 
437 aa  125  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  9.95662e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  32.19 
 
 
463 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  27.79 
 
 
437 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.38921e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  30.38 
 
 
458 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  27.93 
 
 
439 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  29.87 
 
 
459 aa  123  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  31.06 
 
 
437 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  26.97 
 
 
436 aa  122  1e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  34.08 
 
 
441 aa  122  1e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  31.4 
 
 
451 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  34.68 
 
 
436 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  31.49 
 
 
444 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  29.75 
 
 
454 aa  121  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  32.28 
 
 
389 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  30.95 
 
 
436 aa  120  5e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  28.15 
 
 
473 aa  119  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  25.65 
 
 
437 aa  119  1e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  35.45 
 
 
514 aa  119  1e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.03 
 
 
441 aa  119  1e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  29.27 
 
 
462 aa  119  2e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  31.03 
 
 
441 aa  118  2e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  31.83 
 
 
444 aa  118  2e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  31.06 
 
 
451 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  25.99 
 
 
439 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  27.33 
 
 
454 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  3.54037e-08 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  26.43 
 
 
458 aa  117  4e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  31.72 
 
 
461 aa  117  4e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  26.56 
 
 
462 aa  117  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  29.68 
 
 
455 aa  116  7e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  30.9 
 
 
444 aa  116  8e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  30.82 
 
 
465 aa  116  9e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  35.62 
 
 
499 aa  116  9e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  29.21 
 
 
465 aa  116  9e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  29.02 
 
 
474 aa  115  1e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  28.76 
 
 
458 aa  115  1e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>