132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0016 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3981  transposase  100 
 
 
131 aa  271  2e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3127  transposase  100 
 
 
131 aa  271  2e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  6.27522e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0016  transposase  100 
 
 
131 aa  271  2e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  6.47262e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0435  transposase  99.24 
 
 
131 aa  269  8e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.7279e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2046  transposase  99.24 
 
 
131 aa  269  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0564097  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1912  transposase  99.24 
 
 
131 aa  269  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0701676  hitchhiker  6.37024e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2798  transposase  98.47 
 
 
131 aa  268  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340793  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2390  transposase  99.24 
 
 
131 aa  268  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.224522  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1556  transposase  98.47 
 
 
131 aa  268  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.19956  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1757  transposase  99.24 
 
 
131 aa  268  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926733  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0644  transposase  98.47 
 
 
131 aa  267  3e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  hitchhiker  0.00011649 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2067  transposase  98.47 
 
 
131 aa  267  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0302377  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2000  transposase  98.47 
 
 
131 aa  267  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.683542  hitchhiker  0.00023796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3734  transposase  98.47 
 
 
131 aa  267  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.475497  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0093  transposase  98.47 
 
 
131 aa  266  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2297  transposase  98.47 
 
 
131 aa  266  9e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000692881  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0934  transposase  98.47 
 
 
131 aa  266  9e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  4.18233e-05  normal  0.0829612 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2642  transposase  97.71 
 
 
131 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2116  transposase  97.71 
 
 
131 aa  265  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4488  transposase  97.71 
 
 
131 aa  265  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  0.0142246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0340  transposase  96.95 
 
 
131 aa  263  6e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.487576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1644  transposase  96.95 
 
 
131 aa  263  6e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.520277 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1549  transposase  96.95 
 
 
131 aa  263  6e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  5.48512e-08  normal  0.103876 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0777  transposase  96.18 
 
 
131 aa  260  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3709  transposase  90.08 
 
 
131 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76368  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3586  transposase  90.08 
 
 
131 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.865682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3515  transposase  90.08 
 
 
131 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3225  transposase  90.08 
 
 
131 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2778  transposase  90.08 
 
 
131 aa  244  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2603  transposase  89.31 
 
 
131 aa  240  4e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.01028e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1382  transposase  89.31 
 
 
131 aa  240  4e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4289  transposase  88.55 
 
 
131 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  89.08 
 
 
409 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2793  transposase  87.88 
 
 
99 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.0738e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1381  transposase  87.88 
 
 
99 aa  184  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0085723  normal  0.397521 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3491  transposase  64.75 
 
 
135 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.503078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2587  transposase  64.75 
 
 
135 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168791  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1728  transposase  64.75 
 
 
135 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000136689  normal  0.0656378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1234  transposase  64.75 
 
 
135 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3306  transposase  64.75 
 
 
135 aa  167  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1623  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1018  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0189019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0682  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0573  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0389976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0798  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4069  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2572  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  2.1064e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3083  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2331  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1976  transposase  62.99 
 
 
127 aa  167  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0455365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1370  transposase  64.75 
 
 
135 aa  166  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297697 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0465  transposase  60.77 
 
 
131 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3339  transposase  60.77 
 
 
131 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.880716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3563  transposase  60.77 
 
 
131 aa  166  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0402  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1915  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.794502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2424  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2465  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.364332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0023  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0016  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3706  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1494  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1105  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  2.99322e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1615  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3258  transposase  66.39 
 
 
132 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  62.96 
 
 
411 aa  164  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  62.96 
 
 
411 aa  164  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  62.96 
 
 
411 aa  164  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  62.96 
 
 
411 aa  164  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  62.96 
 
 
411 aa  164  3e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  3.53059e-06 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1674  transposase  64.71 
 
 
132 aa  163  7e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2987  transposase  64.71 
 
 
132 aa  163  7e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0870  transposase  64.71 
 
 
132 aa  163  7e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432623  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0716  putative transposase orfA  63.11 
 
 
130 aa  157  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0936  transposase orfA  64.41 
 
 
126 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506606  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  52.76 
 
 
132 aa  130  7e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4442  transposase  56.25 
 
 
135 aa  129  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1880  transposase  56.25 
 
 
135 aa  129  1e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2539  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3057  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2306  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2171  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.680566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3617  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.659641  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2542  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2323  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3283  transposase  55.45 
 
 
133 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267707  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4905  ISPsy11, transposase OrfA  45.52 
 
 
133 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2788  ISPsy11, transposase OrfA  50.42 
 
 
132 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1019  ISPsy11, transposase OrfA  50.42 
 
 
132 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00833205  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1120  ISPsy11, transposase OrfA  50.42 
 
 
132 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123327  normal  0.37757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2673  ISPsy11, transposase OrfA  50.42 
 
 
132 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3618  ISPsy11, transposase OrfA  50.42 
 
 
132 aa  119  1e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1877  ISPsy11, transposase OrfA  45.52 
 
 
133 aa  119  2e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137116  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.99594e-06  hitchhiker  1.66407e-07 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  50 
 
 
405 aa  118  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.71981e-06  decreased coverage  8.62956e-08 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1951  ISPsy11, transposase OrfA  49.59 
 
 
132 aa  118  2e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183596  normal  0.0546962 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>