More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0015 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3980  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.125694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1999  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555905  hitchhiker  0.000256673 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1555  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  554  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000209359  normal  0.14515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0933  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.74651e-05  normal  0.0960568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3128  integrase catalytic subunit  100 
 
 
267 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  2.15252e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4489  integrase catalytic region  99.25 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344877  normal  0.0155071 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2117  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2643  integrase catalytic region  99.25 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0015  integrase catalytic subunit  100 
 
 
267 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  2.2055e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0434  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  556  1e-157  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  9.20784e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3735  integrase catalytic subunit  99.63 
 
 
267 aa  555  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.333403  hitchhiker  0.00196761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0643  integrase catalytic subunit  99.25 
 
 
267 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  4.25795e-05 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1756  integrase catalytic subunit  98.88 
 
 
267 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.651676  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2797  integrase catalytic subunit  98.88 
 
 
267 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.16027  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2066  integrase catalytic subunit  99.25 
 
 
267 aa  553  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0779569  hitchhiker  0.00044275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0776  integrase catalytic subunit  99.25 
 
 
267 aa  550  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0276639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2389  integrase catalytic subunit  98.88 
 
 
267 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2296  integrase catalytic region  98.13 
 
 
267 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000687503  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1645  integrase catalytic subunit  98.5 
 
 
267 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1550  integrase catalytic subunit  98.5 
 
 
267 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.64149e-07  normal  0.116153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0092  integrase catalytic subunit  98.13 
 
 
267 aa  548  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0341  integrase catalytic subunit  98.5 
 
 
267 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.683764  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1911  integrase catalytic subunit  97.75 
 
 
267 aa  544  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.050447  hitchhiker  7.22293e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2045  integrase catalytic subunit  99.22 
 
 
269 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.391436  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  88.76 
 
 
409 aa  501  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3710  integrase catalytic region  89.02 
 
 
255 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910122  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3226  integrase catalytic region  88.24 
 
 
255 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3516  integrase catalytic region  88.24 
 
 
255 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2779  integrase catalytic region  88.24 
 
 
255 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.475314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3587  integrase catalytic region  88.24 
 
 
255 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2794  integrase catalytic region  87.84 
 
 
255 aa  474  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0127686  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1380  integrase catalytic region  87.84 
 
 
255 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1381  integrase catalytic subunit  88.24 
 
 
255 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2602  integrase catalytic region  87.7 
 
 
266 aa  466  1e-130  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000237976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  65.17 
 
 
411 aa  355  4e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  65.17 
 
 
411 aa  355  4e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  3.53059e-06 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  65.17 
 
 
411 aa  355  4e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  65.17 
 
 
411 aa  355  4e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  65.17 
 
 
411 aa  355  4e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4293  integrase catalytic subunit  89.13 
 
 
188 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.942529  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0715  integrase catalytic subunit  62.93 
 
 
268 aa  339  3e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0983759  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0403  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0015  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0024  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1106  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  1.08961e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1495  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2423  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1614  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00380758  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1916  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3257  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3707  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2466  integrase catalytic region  66.39 
 
 
250 aa  337  1e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.206466  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0572  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00083454  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0681  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.454705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0799  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3082  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2330  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4070  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1017  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124001  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1622  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1977  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  336  2e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.014201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2573  integrase catalytic region  63.9 
 
 
242 aa  335  4e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  1.21412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3340  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
242 aa  334  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0464  integrase catalytic subunit  63.07 
 
 
242 aa  333  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3562  integrase catalytic subunit  63.49 
 
 
242 aa  332  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1729  integrase catalytic region  68.56 
 
 
240 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0010108  normal  0.0687454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2586  integrase catalytic region  68.56 
 
 
240 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  normal  0.220719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3490  integrase catalytic region  68.56 
 
 
240 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.240765  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1371  integrase catalytic region  68.56 
 
 
240 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739659 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1233  integrase catalytic region  68.56 
 
 
240 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3305  integrase catalytic region  68.56 
 
 
240 aa  327  1e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0937  putative transposase OrfB  65.33 
 
 
234 aa  311  5e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.43261  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0869  ISPsy11, transposase OrfB  56.03 
 
 
278 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.211995  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1673  ISPsy11, transposase OrfB  56.03 
 
 
278 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0198779  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2988  ISPsy11, transposase OrfB  56.03 
 
 
278 aa  293  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.556396  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0757  integrase catalytic subunit  49.81 
 
 
287 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1224  integrase catalytic subunit  49.81 
 
 
287 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.127242  normal  0.935369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3089  integrase catalytic subunit  49.81 
 
 
287 aa  236  3e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000165574  normal  0.198511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2032  integrase catalytic subunit  49.04 
 
 
265 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.778861  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1347  integrase catalytic subunit  49.04 
 
 
265 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.340064  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2131  integrase catalytic subunit  49.04 
 
 
265 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0068  integrase catalytic subunit  49.04 
 
 
265 aa  234  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3248  hypothetical protein  49.81 
 
 
405 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.634326  decreased coverage  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3004  hypothetical protein  49.81 
 
 
405 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  1.71981e-06  decreased coverage  8.62956e-08 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2022  hypothetical protein  49.81 
 
 
405 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0743871  hitchhiker  0.0039543 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2976  hypothetical protein  49.81 
 
 
405 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0838011  normal  0.0444014 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0894  hypothetical protein  49.81 
 
 
405 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1794  hypothetical protein  49.81 
 
 
405 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  7.99594e-06  hitchhiker  1.66407e-07 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3398  Integrase catalytic region  47.13 
 
 
266 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.481157  hitchhiker  0.00717467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3619  Integrase catalytic region  49.25 
 
 
275 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1020  Integrase catalytic region  49.25 
 
 
275 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0127809  normal  0.102999 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1121  Integrase catalytic region  49.25 
 
 
275 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.319889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4511  ISPsy11, transposase OrfB  48.66 
 
 
265 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.5786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2787  Integrase catalytic region  48.88 
 
 
275 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4947  hypothetical protein  47.51 
 
 
263 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2672  Integrase catalytic region  48.88 
 
 
275 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.393595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5925  hypothetical protein  47.51 
 
 
263 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.14498  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5133  hypothetical protein  47.13 
 
 
263 aa  226  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2142  integrase catalytic subunit  50.85 
 
 
240 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  3.18686e-06  hitchhiker  0.000276825 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2126  integrase catalytic subunit  50.85 
 
 
240 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0319938  hitchhiker  0.00709145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>