More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0005 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  1.52518e-11 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  98.17 
 
 
218 aa  446  1e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0533093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0013  glutathione S-transferase domain-containing protein  97.25 
 
 
218 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  9.75013e-09 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0012  glutathione S-transferase family protein  88.18 
 
 
220 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.82 
 
 
220 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  81.36 
 
 
220 aa  380  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0120161 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0005  glutathione S-transferase domain-containing protein  80.91 
 
 
220 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0005  Glutathione S-transferase domain protein  80.91 
 
 
220 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  7.59122e-10 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0424  glutathione S-transferase domain-containing protein  72.02 
 
 
219 aa  328  5e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05534  glutathione S-transferase  52.07 
 
 
215 aa  244  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0374  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.84 
 
 
217 aa  223  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0814599  normal  0.0308009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3341  Glutathione S-transferase domain protein  45.79 
 
 
229 aa  204  8e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0086  hypothetical protein  44.86 
 
 
229 aa  203  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.851127  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0178  glutathione S-transferase-like protein  46.26 
 
 
229 aa  201  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3664  Glutathione S-transferase domain  45.33 
 
 
229 aa  200  1e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3120  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.54 
 
 
215 aa  197  1e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4787  putative glutathione S-transferase (GST)  46.3 
 
 
219 aa  192  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0259  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
215 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.118169  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0235  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
234 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2428  glutathione S-transferase-like  47.25 
 
 
218 aa  190  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.470962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0456  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
218 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0271  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
215 aa  190  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.791762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3362  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
215 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2986  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
215 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2106  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
218 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3316  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.92 
 
 
218 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3568  Glutathione S-transferase domain  45.58 
 
 
218 aa  188  6e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6379  glutathione S-transferase-like protein  45.02 
 
 
215 aa  187  9e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0523  Glutathione S-transferase domain protein  42.86 
 
 
228 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2384  glutathione S-transferase-like protein  47.39 
 
 
218 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00711866  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0507  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.41 
 
 
228 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.0384549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 
215 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.561118  normal  0.706349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3032  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
215 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.865066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2418  glutathione S-transferase-like  44.55 
 
 
215 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3077  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
215 aa  184  1e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3051  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.55 
 
 
215 aa  184  1e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0255759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1470  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 
229 aa  182  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3336  glutathione S-transferase-like  46.98 
 
 
218 aa  182  5e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3297  hypothetical protein  42.22 
 
 
234 aa  182  5e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.210866  normal  0.103895 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4206  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.81 
 
 
228 aa  180  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.779157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0700  Glutathione S-transferase domain protein  45.33 
 
 
214 aa  180  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3027  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.13 
 
 
215 aa  179  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.890622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3912  hypothetical protein  42.15 
 
 
230 aa  179  3e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.874335  normal  0.368309 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4340  glutathione S-transferase  42.47 
 
 
219 aa  178  6e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3070  glutathione S-transferase-like  45.5 
 
 
218 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.15979  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0221  glutathione S-transferase  43.46 
 
 
229 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3154  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.95 
 
 
227 aa  177  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.861762  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1259  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.46 
 
 
229 aa  176  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4314  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
221 aa  176  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1706  glutathione S-transferase  43.93 
 
 
218 aa  175  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.644809  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4154  Glutathione S-transferase domain protein  42.92 
 
 
215 aa  175  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.930839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3467  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.62 
 
 
231 aa  175  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3193  glutathione S-transferase-like protein  44.02 
 
 
222 aa  174  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2898  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 
215 aa  171  6e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6895  Glutathione S-transferase domain  41.63 
 
 
217 aa  171  7e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.134635  normal  0.66105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1541  Glutathione S-transferase domain protein  44.29 
 
 
228 aa  171  8e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0002  glutathione S-transferase-like protein  45.74 
 
 
223 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0515777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2940  glutathione S-transferase  41.15 
 
 
217 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4215  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.23 
 
 
220 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0158899 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1089  glutathione S-transferase-like  37.95 
 
 
227 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4972  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.2 
 
 
209 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2364  glutathione S-transferase-like protein  44.08 
 
 
220 aa  166  3e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0709999  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57200  putative glutathione S-transferase  43.69 
 
 
211 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3732  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.38 
 
 
239 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4632  glutathione S-transferase-like  42.38 
 
 
239 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.517858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2921  Glutathione S-transferase domain protein  44.44 
 
 
228 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3789  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.38 
 
 
220 aa  164  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181151  normal  0.0204408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0580  glutathione S-transferase-like  43.66 
 
 
224 aa  164  1e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.724559  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0763  glutathione S-transferase  40.09 
 
 
217 aa  164  1e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3826  Glutathione S-transferase domain  40.19 
 
 
215 aa  163  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2755  glutathione S-transferase-like protein  39.52 
 
 
218 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155229 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3614  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.6 
 
 
220 aa  162  4e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.922528  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2700  glutathione S-transferase-like protein  40.38 
 
 
218 aa  162  5e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.422305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.54 
 
 
210 aa  161  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.250168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2405  Glutathione S-transferase domain protein  43.46 
 
 
227 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1217  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
219 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0200  glutathione S-transferase  42.65 
 
 
217 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0990  Glutathione S-transferase domain protein  40.09 
 
 
227 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6278  putative maleylacetoacetate isomerase (MAAI) (glutathione S- transferase)  40.39 
 
 
217 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1684  glutathione S-transferase-like protein  38.79 
 
 
218 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1672  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.71 
 
 
217 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252264 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1959  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.62 
 
 
217 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.399077  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0753  Glutathione S-transferase domain protein  39.81 
 
 
217 aa  155  6e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13360  glutathione S-transferase family protein  40.85 
 
 
214 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1566  glutathione S-transferase  40.48 
 
 
219 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0453975  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0742  glutathione S-transferase-like protein  40.49 
 
 
212 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0491296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2500  Glutathione S-transferase domain protein  43.48 
 
 
228 aa  153  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0624  Glutathione S-transferase domain protein  38.83 
 
 
217 aa  152  3e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0101229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4502  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.23 
 
 
210 aa  152  3e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282964  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04608  glutathione S-transferase  42.44 
 
 
213 aa  151  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549894  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4377  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.06 
 
 
210 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal  0.0169284 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3437  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.05 
 
 
208 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.303772  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4092  glutathione S-transferase  39.13 
 
 
208 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2073  glutathione S-transferase-like  39.22 
 
 
248 aa  148  6e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.970271  normal  0.0981528 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0107  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.71 
 
 
241 aa  148  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372034 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2135  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.65 
 
 
216 aa  147  1e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3736  glutathione S-transferase  40.65 
 
 
217 aa  146  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0954  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.58 
 
 
210 aa  146  2e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.428451  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4995  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.62 
 
 
218 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000401874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1900  glutathione S-transferase-like protein  37.25 
 
 
218 aa  145  4e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>