More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4335 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4335  peptide methionine sulfoxide reductase  100 
 
 
162 aa  335  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  55.13 
 
 
168 aa  187  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  50.31 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.63 
 
 
322 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  52.5 
 
 
168 aa  180  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
171 aa  180  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  53.21 
 
 
169 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
168 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2142  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
169 aa  176  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0856745  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  49.69 
 
 
172 aa  176  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  53.85 
 
 
168 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  50.96 
 
 
311 aa  175  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  51.55 
 
 
162 aa  175  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1105  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
169 aa  174  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.783712 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  50.93 
 
 
172 aa  174  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  51.61 
 
 
171 aa  174  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
167 aa  174  6e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
168 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  48.45 
 
 
169 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  50 
 
 
173 aa  169  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  49.07 
 
 
169 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
171 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  49.07 
 
 
169 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  47.83 
 
 
166 aa  167  7e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  47.83 
 
 
170 aa  167  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  52.56 
 
 
182 aa  167  7e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  49.07 
 
 
168 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4325  methionine sulfoxide reductase A  46.58 
 
 
166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  47.83 
 
 
172 aa  164  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  47.44 
 
 
167 aa  164  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  50.64 
 
 
175 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  48.08 
 
 
168 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0394  peptide methionine sulfoxide reductase  48.41 
 
 
177 aa  162  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  46.58 
 
 
166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  48.72 
 
 
179 aa  160  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  48.08 
 
 
179 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  51.75 
 
 
150 aa  160  7e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  47.83 
 
 
177 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  49.36 
 
 
179 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  51.01 
 
 
228 aa  158  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  46.15 
 
 
178 aa  158  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2505  peptide methionine sulfoxide reductase  45.91 
 
 
178 aa  158  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353666  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2259  peptide methionine sulfoxide reductase  45.81 
 
 
177 aa  157  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00118582  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  47.44 
 
 
178 aa  157  8e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  47.13 
 
 
197 aa  157  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  49.66 
 
 
181 aa  155  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1394  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.67 
 
 
334 aa  155  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00174271  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0190  methionine sulfoxide reductase A  49.33 
 
 
176 aa  155  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  46.79 
 
 
179 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  47.77 
 
 
184 aa  154  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0511  peptide methionine sulfoxide reductase  46.54 
 
 
183 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340853  normal  0.134723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4817  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  45.7 
 
 
184 aa  154  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  48.32 
 
 
225 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  49.65 
 
 
163 aa  153  8e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2934  methionine-S-oxide reductase  45.22 
 
 
182 aa  153  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0271  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 
201 aa  153  9e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.453594  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3224  peptide methionine sulfoxide reductase  47.71 
 
 
182 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0306  peptide methionine sulfoxide reductase  43.04 
 
 
182 aa  153  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  48.67 
 
 
180 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3719  peptide methionine sulfoxide reductase  46.1 
 
 
183 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.836534  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1776  protein-methionine-S-oxide reductase  48.3 
 
 
212 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0416821  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.74 
 
 
351 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1141  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.35 
 
 
338 aa  152  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1074  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  49.67 
 
 
290 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.150289 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1088  trifunctional thioredoxin/methionine sulfoxide reductase A/B protein  45.81 
 
 
611 aa  151  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.541227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2645  methionine sulfoxide reductase A  45.86 
 
 
180 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2491  peptide methionine sulfoxide reductase  52.78 
 
 
210 aa  150  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306837  normal  0.147522 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0843  peptide methionine sulfoxide reductase  47.68 
 
 
209 aa  150  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.207853 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10562  peptide methionine sulfoxide reductase (Eurofung)  44.17 
 
 
213 aa  150  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53989  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0812  methionine sulfoxide reductase A  45.22 
 
 
180 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0905  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.44 
 
 
284 aa  149  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  44.52 
 
 
181 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4063  peptide methionine sulfoxide reductase  44.08 
 
 
180 aa  149  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00147413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3422  peptide methionine sulfoxide reductase  52.08 
 
 
220 aa  149  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  44.16 
 
 
158 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  46.67 
 
 
183 aa  149  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  50 
 
 
184 aa  149  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4592  methionine-R-sulfoxide reductase  46.45 
 
 
368 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0960  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  47.06 
 
 
287 aa  148  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3952  peptide methionine sulfoxide reductase  42.14 
 
 
178 aa  148  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106741  normal  0.0202852 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2913  methionine sulfoxide reductase A  44.1 
 
 
157 aa  148  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.169156  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2075  methionine sulfoxide reductase A  45.22 
 
 
175 aa  148  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.610074  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  45.28 
 
 
185 aa  147  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0738  peptide methionine sulfoxide reductase  47.06 
 
 
182 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.931783  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1385  methionine-R-sulfoxide reductase  44.52 
 
 
359 aa  146  9e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6050  peptide methionine sulfoxide reductase  43.67 
 
 
228 aa  146  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0375949  normal  0.155046 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  45.16 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1447  peptide methionine sulfoxide reductase  45.22 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3532  methionine sulfoxide reductase A  45.64 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0197931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03638  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  47.74 
 
 
181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.588348  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3453  peptide methionine sulfoxide reductase  44.67 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  42.24 
 
 
179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1674  peptide methionine sulfoxide reductase  44.81 
 
 
180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.427343  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2591  methionine sulfoxide reductase A  42.86 
 
 
157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0501  peptide methionine sulfoxide reductase  43.48 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3364  methionine sulfoxide reductase A  44.87 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4142  methionine sulfoxide reductase A  46.67 
 
 
186 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.330473  normal  0.0121487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  43.31 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>