19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4248 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4248  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  904    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.947193  decreased coverage  0.000181911 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6141  hypothetical protein  45.75 
 
 		 435 aa  358  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2312  hypothetical protein  44.27 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3157  hypothetical protein  37.59 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5211  hypothetical protein  37.59 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0663  hypothetical protein  36.43 
 
 		 425 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5066  hypothetical protein  38.32 
 
 		 369 aa  242  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4813  hypothetical protein  33.33 
 
 		 422 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2166  hypothetical protein  34.83 
 
 		 419 aa  222  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2209  hypothetical protein  36.03 
 
 		 457 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0938  hypothetical protein  36.02 
 
 		 455 aa  196  7e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1470  hypothetical protein  37.57 
 
 		 455 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0902168  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2879  hypothetical protein  32.19 
 
 		 454 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.494797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1108  PP-loop superfamily ATPase-like protein  27.64 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0264  hypothetical protein  27.88 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1935  hypothetical protein  25.94 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.128997 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3225  hypothetical protein  30 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3026  hypothetical protein  27.43 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.182081  normal  0.966311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1806  hypothetical protein  25.47 
 
 		 458 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216728  normal  0.521585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>