14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4243 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4243  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025011 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0030  hypothetical protein  71.43 
 
 		 311 aa  159  8.000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.304564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0238  hypothetical protein  60.95 
 
 		 312 aa  132  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0886  hypothetical protein  57.69 
 
 		 315 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2191  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.25203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2290  hypothetical protein  50.48 
 
 		 316 aa  107  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0511  hypothetical protein  48.08 
 
 		 308 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.457472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0005  conserved hypothetical protein (DUF511 domain protein)  44.12 
 
 		 333 aa  83.6  9e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1717  hypothetical protein  42.86 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1623  hypothetical protein  43.96 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2021  hypothetical protein  48.57 
 
 		 70 aa  77.4  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101618 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1748  HrgA protein  42.71 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1774  HrgA protein  39.8 
 
 		 312 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.508173  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1589  HrgA protein  31.63 
 
 		 300 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>