25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4238 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4238  hypothetical protein  100 
 
 		 746 aa  1539    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.648959  hitchhiker  0.00399627 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1151  hypothetical protein  35.95 
 
 		 743 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.515935  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  36 
 
 		 757 aa  440  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0033  hypothetical protein  34.42 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39480  hypothetical protein  26.94 
 
 		 717 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000519045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0106  hypothetical protein  26.73 
 
 		 721 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  25.65 
 
 		 710 aa  197  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2644  hypothetical protein  24.81 
 
 		 643 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5563  hypothetical protein  23.14 
 
 		 792 aa  93.6  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1503  hypothetical protein  22.91 
 
 		 792 aa  75.1  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.269689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3987  hypothetical protein  25.05 
 
 		 803 aa  65.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0471  hypothetical protein  22.73 
 
 		 771 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1721  RloC protein, putative  26.79 
 
 		 776 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1985  hypothetical protein  21.99 
 
 		 771 aa  60.8  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.229709  normal  0.0294644 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0566  hypothetical protein  24.14 
 
 		 810 aa  54.3  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.913605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2619  hypothetical protein  29.03 
 
 		 767 aa  54.3  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.373268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4229  hypothetical protein  29.75 
 
 		 722 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0264095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2637  hypothetical protein  27.42 
 
 		 767 aa  52.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.594259  normal  0.040177 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1874  hypothetical protein  27.35 
 
 		 753 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1868  hypothetical protein  27.42 
 
 		 818 aa  52.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141951  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4292  hypothetical protein  20.83 
 
 		 770 aa  52  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1967  hypothetical protein  36.36 
 
 		 844 aa  48.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.972801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2428  hypothetical protein  22.75 
 
 		 849 aa  47  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0793097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3841  hypothetical protein  32.14 
 
 		 895 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3111  hypothetical protein  22.56 
 
 		 765 aa  44.3  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>