More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4229 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4229  single-strand binding protein  100 
 
 		 175 aa  350  8e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201329  normal  0.0453464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  54.61 
 
 		 238 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 236 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 231 aa  147  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  59.81 
 
 		 236 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  55.65 
 
 		 222 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  50.88 
 
 		 235 aa  143  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  50.88 
 
 		 236 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  59.81 
 
 		 234 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  48.08 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  46.41 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  50 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  48.05 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  44.51 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  51.16 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  51.16 
 
 		 165 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  47.74 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  43.58 
 
 		 200 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 171 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  53.64 
 
 		 178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  45.27 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  51.54 
 
 		 201 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  43.71 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  48.91 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  44.38 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  50.77 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  47.1 
 
 		 189 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  52.46 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  55.36 
 
 		 184 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  54.63 
 
 		 180 aa  125  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  42.94 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  52.29 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  46.92 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  52.29 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  52.25 
 
 		 183 aa  124  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  48.76 
 
 		 168 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  45.65 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  52.68 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  47.68 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 161 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  50.41 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  51.35 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0611  single-stranded DNA-binding protein  53.15 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0751618  hitchhiker  0.00325806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  47.37 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  42.41 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  44.51 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  53.1 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  51.79 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  50.44 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  46.32 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  47.32 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 167 aa  121  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  48.25 
 
 		 182 aa  121  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  52.29 
 
 		 178 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  55.34 
 
 		 181 aa  120  7e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  54.37 
 
 		 181 aa  120  9e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  51.35 
 
 		 172 aa  120  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  44.68 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  49.09 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 181 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  49.09 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  44.06 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 192 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 179 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  45.54 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  48.21 
 
 		 167 aa  119  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>