83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4224 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4224  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.936707  normal  0.82273 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4095  IS605 family transposase OrfB  70.18 
 
 
385 aa  84.7  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.646881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3404  transposase, IS605 OrfB  73.08 
 
 
96 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.513749 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2014  IS605 family transposase OrfB  69.81 
 
 
368 aa  78.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0206  IS605 family transposase OrfB  69.09 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107304  normal  0.275881 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0367  IS605 family transposase OrfB  69.09 
 
 
368 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292171  hitchhiker  0.000610629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0178  IS605 family transposase OrfB  68.52 
 
 
368 aa  77  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.116518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2229  IS605 family transposase OrfB  65.45 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.626337  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2274  IS605 family transposase OrfB  66.67 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.683357  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0195  IS605 family transposase OrfB  64.81 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000522338  hitchhiker  0.00591521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1587  transposase  63.64 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1669  IS605 family transposase OrfB  64.81 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000382916  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0626  IS605 family transposase OrfB  64.81 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.511455 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0117  IS605 family transposase OrfB  64.81 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1392  IS605 family transposase OrfB  66.04 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1710  IS605 family transposase OrfB  64.81 
 
 
368 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0141  IS605 family transposase OrfB  64.15 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0197  IS605 family transposase OrfB  62.96 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00374604  normal  0.012481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1070  IS605 family transposase OrfB  62.96 
 
 
368 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1078  IS605 family transposase OrfB  62.96 
 
 
368 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.491952 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1777  IS605 family transposase OrfB  62.96 
 
 
382 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.872149  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1918  IS605 family transposase OrfB  62.96 
 
 
368 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.794577  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0603  IS605 family transposase OrfB  62.96 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000602686  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  54.55 
 
 
355 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  54.55 
 
 
355 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6039  IS605 family transposase OrfB  45.65 
 
 
350 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.767998  normal  0.985629 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6014  IS605 family transposase OrfB  45.65 
 
 
350 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5909  IS605 family transposase OrfB  41.07 
 
 
350 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5544  transposase, IS605 OrfB  41.07 
 
 
350 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.518221  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3232  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
353 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0466182  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3911  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5135  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
353 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.767848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3834  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.885241 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5462  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288769 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6095  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4780  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3118  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0713  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
353 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429741  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4129  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.426734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1598  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.301162 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1613  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6049  transposase, IS605 OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5061  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.149443  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5122  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
353 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.331521 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5338  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.522659 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5405  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6181  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.252377  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1192  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
353 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2028  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0971248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3387  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3435  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0563204  normal  0.146196 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4247  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.866566  normal  0.0328861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3363  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684311  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5249  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3743  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329544  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3489  transposase, IS605 OrfB family  39.39 
 
 
409 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6476  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.037222  normal  0.870894 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4147  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0972237  normal  0.0676956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4217  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.513671 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4308  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0403457  normal  0.908635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5305  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0621738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1547  IS605 family transposase OrfB  43.48 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3944  transposase, IS605 OrfB  41.67 
 
 
194 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4422  transposase, IS605 OrfB  41.67 
 
 
194 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.531267  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  41.82 
 
 
408 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5884  IS605 family transposase OrfB  41.3 
 
 
398 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.465114  normal  0.225527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  50 
 
 
351 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0125  transposase, IS605 OrfB  41.67 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0608  IS605 family transposase OrfB  41.67 
 
 
142 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  41.82 
 
 
408 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  31.88 
 
 
406 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  43.48 
 
 
399 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1159  transposase, IS605 OrfB family  48.94 
 
 
416 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  38.18 
 
 
411 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  48 
 
 
400 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2549  transposase, IS605 OrfB family  48.94 
 
 
370 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735833  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  38.78 
 
 
411 aa  41.2  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  43.86 
 
 
351 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  48 
 
 
351 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  48 
 
 
351 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  48 
 
 
351 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2044  transposase, IS605 OrfB family  42.86 
 
 
418 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2754  transposase, IS605 OrfB family  32.81 
 
 
363 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>