23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4223 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  638    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.697146 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0260  hypothetical protein  52.01 
 
 		 305 aa  318  7e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2780  hypothetical protein  48.22 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0971539  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_49  hypothetical protein  29.18 
 
 		 319 aa  115  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0169531  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4475  protein of unknown function DUF1526  29.6 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681857  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3948  hypothetical protein  27.74 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1079  protein of unknown function DUF1526  23.21 
 
 		 246 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4147  hypothetical protein  26.63 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0597  hypothetical protein  20.8 
 
 		 224 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.954622  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5597  hypothetical protein  24.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000586363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2034  hypothetical protein  24.68 
 
 		 220 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00168  hypothetical protein  24.64 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1986  hypothetical protein  22.95 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4403  hypothetical protein  25.71 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0328  protein of unknown function DUF1526  20.74 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497384 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07930  Protein of unknown function (DUF1526)  25.38 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12147  normal  0.318525 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7743  protein of unknown function DUF1526  24.71 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2443  protein of unknown function DUF1526  22.61 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376322  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3917  protein of unknown function DUF1526  24.59 
 
 		 288 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0681  protein of unknown function DUF1526  24 
 
 		 233 aa  46.6  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0149  hypothetical protein  25.65 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0183  protein of unknown function DUF1526  23.76 
 
 		 153 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.289479  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1634  hypothetical protein  26.67 
 
 		 194 aa  44.3  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.414532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>