44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4218 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4218  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  100 
 
 		 894 aa  1867    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.750787 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  26.05 
 
 		 815 aa  260  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  25.87 
 
 		 809 aa  225  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  22.65 
 
 		 866 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  22.64 
 
 		 815 aa  161  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  23.64 
 
 		 864 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  22.57 
 
 		 815 aa  157  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  24.33 
 
 		 864 aa  155  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  24.09 
 
 		 690 aa  154  8.999999999999999e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3777  sex pilus assembly protein  24.69 
 
 		 816 aa  144  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.899145  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  23.44 
 
 		 874 aa  144  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2653  hypothetical protein  24.61 
 
 		 855 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.696195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2320  hypothetical protein  24.61 
 
 		 855 aa  131  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.121695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.27 
 
 		 860 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  26.8 
 
 		 868 aa  127  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  23.89 
 
 		 827 aa  124  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  24.1 
 
 		 847 aa  124  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  23.23 
 
 		 866 aa  120  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  26.01 
 
 		 862 aa  109  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  22.95 
 
 		 862 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  22.95 
 
 		 862 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  22.95 
 
 		 862 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  22.95 
 
 		 862 aa  106  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  22.95 
 
 		 862 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6224  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.1 
 
 		 860 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_08  conjugative transfer protein TraC  25.33 
 
 		 843 aa  100  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0028  hypothetical protein  21.51 
 
 		 858 aa  94.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0798103  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  23.57 
 
 		 865 aa  92.8  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  20.69 
 
 		 875 aa  89.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.44 
 
 		 608 aa  62.4  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  20.96 
 
 		 841 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  23.11 
 
 		 843 aa  58.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.29 
 
 		 861 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0648  hypothetical protein  23.38 
 
 		 908 aa  55.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.685695  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  18.58 
 
 		 1043 aa  53.5  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a009  secretion/conjugal transfer ATPase VirB3/4  21 
 
 		 924 aa  52.4  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  21.93 
 
 		 845 aa  50.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4357  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.72 
 
 		 819 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.471619  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.59 
 
 		 811 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3004  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.58 
 
 		 837 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  19.91 
 
 		 792 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.73 
 
 		 611 aa  46.2  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0028  cmgB3/4  19.2 
 
 		 922 aa  44.7  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2392  hypothetical protein  30.48 
 
 		 924 aa  44.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>