More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4215 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4215  helicase domain-containing protein  100 
 
 
664 aa  1375    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00111168  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2813  helicase domain protein  30.14 
 
 
653 aa  272  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.208739  normal  0.570688 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0389  RecG-like helicase  31.27 
 
 
636 aa  258  3e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0493519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3682  helicase domain-containing protein  33.06 
 
 
629 aa  185  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1682  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.6 
 
 
671 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.193208  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2553  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.96 
 
 
681 aa  182  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1286  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.05 
 
 
686 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1311  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.05 
 
 
686 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1077  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.6 
 
 
682 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.012078  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1401  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.13 
 
 
701 aa  178  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413204  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0449  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.76 
 
 
676 aa  176  9.999999999999999e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0217624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0793  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.64 
 
 
682 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0640  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.36 
 
 
691 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0771  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.68 
 
 
679 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000386747 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0536  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.27 
 
 
676 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1105  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.02 
 
 
799 aa  172  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1650  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.6 
 
 
786 aa  171  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1700  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.57 
 
 
672 aa  171  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.828998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1912  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.32 
 
 
701 aa  170  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.641685  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0406  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.85 
 
 
604 aa  169  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1728  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.59 
 
 
701 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1263  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.66 
 
 
798 aa  167  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00177655  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2085  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.44 
 
 
808 aa  167  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1967  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.37 
 
 
682 aa  167  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2025  ATP-dependent DNA helicase RecG  28 
 
 
691 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2363  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.65 
 
 
790 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1882  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.69 
 
 
689 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.490572  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0756  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.43 
 
 
702 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.622738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1459  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.67 
 
 
903 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.107258 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2402  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.73 
 
 
782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.761831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3492  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.34 
 
 
690 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503881 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1504  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.16 
 
 
695 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2955  ATP-dependent DNA helicase RecG  31 
 
 
715 aa  164  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.741369  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2058  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.83 
 
 
822 aa  164  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0511004  normal  0.682636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2806  ATP-dependent DNA helicase RecG  31 
 
 
728 aa  163  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0348  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.44 
 
 
698 aa  163  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.055955 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1224  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.88 
 
 
679 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2935  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.71 
 
 
702 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.220068  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.08 
 
 
817 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.568332  hitchhiker  0.00243484 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1140  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.21 
 
 
779 aa  161  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.291381  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0743  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.38 
 
 
763 aa  161  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1454  ATP-dependent DNA helicase RecG  24.23 
 
 
693 aa  162  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.858115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2142  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.3 
 
 
700 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118355  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0722  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.38 
 
 
684 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000137671  hitchhiker  0.00000253506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3834  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.97 
 
 
805 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.492162  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0568  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.38 
 
 
684 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.457538  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3642  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.36 
 
 
706 aa  160  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3903  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
682 aa  160  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000501886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2153  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.21 
 
 
690 aa  160  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3614  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
682 aa  160  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.135491  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3706  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
682 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.152385  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3596  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
657 aa  160  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0719  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.14 
 
 
779 aa  160  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3869  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
682 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12234e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3993  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
682 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000184974  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1268  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.31 
 
 
740 aa  158  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.630381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3897  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
682 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00158642  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2545  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.5 
 
 
715 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419698  normal  0.139865 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0311  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.67 
 
 
695 aa  159  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1225  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.03 
 
 
812 aa  158  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.477406 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0632  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.47 
 
 
602 aa  158  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2942  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.54 
 
 
737 aa  158  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2711  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.93 
 
 
671 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0646  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.7 
 
 
733 aa  157  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0126  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.51 
 
 
685 aa  157  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0196  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.12 
 
 
781 aa  157  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.639349  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4415  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.28 
 
 
697 aa  157  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76819  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10071  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.64 
 
 
815 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.212332 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4159  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.42 
 
 
700 aa  157  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.912791 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4880  ATP-dependent DNA helicase RecG  30 
 
 
827 aa  156  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0539602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3954  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.1 
 
 
682 aa  156  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0156287  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34911  predicted protein  29.48 
 
 
539 aa  156  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.207235  normal  0.146138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0329  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.62 
 
 
691 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0231565 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0581  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.8 
 
 
706 aa  155  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165207  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1027  ATP-dependent DNA helicase RecG  29 
 
 
611 aa  155  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.215088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7183  ATP-dependent DNA helicase RecG  32.52 
 
 
704 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.387604  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0546  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.8 
 
 
706 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.196683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1079  ATP-dependent DNA helicase RecG  27.93 
 
 
818 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.357653  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4575  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.77 
 
 
822 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1051  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 
818 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2059  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.39 
 
 
719 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0316192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2305  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.49 
 
 
772 aa  154  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2010  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.84 
 
 
690 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0198  ATP-dependent DNA helicase RecG  26.98 
 
 
691 aa  154  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1279  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.23 
 
 
733 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32853  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1289  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.85 
 
 
682 aa  154  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00448212  hitchhiker  0.00000000161574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1150  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.07 
 
 
818 aa  154  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5358  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.4 
 
 
692 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419369  normal  0.636559 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10468  ATP-dependent DNA helicase recG  27.53 
 
 
700 aa  154  5e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.938842  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1162  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.45 
 
 
678 aa  154  5e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000110827  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1975  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.85 
 
 
704 aa  154  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.589837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2890  ATP-dependent DNA helicase RecG  28.39 
 
 
678 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000445621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3812  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.05 
 
 
777 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2088  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.94 
 
 
685 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4871  ATP-dependent DNA helicase RecG  25.93 
 
 
693 aa  154  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.708486  normal  0.0162728 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3375  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.22 
 
 
691 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1169  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.34 
 
 
733 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182311  hitchhiker  0.00000886556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.15 
 
 
681 aa  153  8e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1498  ATP-dependent DNA helicase RecG  29.43 
 
 
819 aa  153  8e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0163  ATP-dependent DNA helicase RecG  30.9 
 
 
692 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0916873  normal  0.148249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>