106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4194 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4194  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 457 aa  938    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.741265 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0125  C-5 cytosine-specific DNA methylase  61.92 
 
 		 541 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1433  C-5 cytosine-specific DNA methylase  45.99 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2746  C-5 cytosine-specific DNA methylase  44.89 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.264325 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4299  C-5 cytosine-specific DNA methylase  38.5 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0340  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.65 
 
 		 473 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  26.64 
 
 		 436 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.08 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0568  DNA-cytosine methyltransferase  25.48 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.905473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  26.52 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.01 
 
 		 328 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  25.29 
 
 		 323 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 		 416 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  24.56 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  26.77 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  25.25 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  26.45 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  24.46 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  25.9 
 
 		 491 aa  67  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 305 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 		 417 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3927  DNA-cytosine methyltransferase  27.64 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.11 
 
 		 319 aa  65.5  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.55 
 
 		 417 aa  64.7  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  26.3 
 
 		 425 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2742  DNA methylase  27.32 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  22.14 
 
 		 329 aa  64.3  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  24.29 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  25.83 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  26.87 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  28.73 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  23.15 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  24.29 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  24.83 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  24.48 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  24.48 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  25.08 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  24.48 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  24.91 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  25.79 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  24.62 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  24.62 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  24.62 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  24.62 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  23.34 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  22.42 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  24.62 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  21.25 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3202  DNA-cytosine methyltransferase  25.95 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000317903  unclonable  0.0000000000251181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  25.86 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  28.16 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  23.05 
 
 		 727 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36050  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.19 
 
 		 501 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  27.08 
 
 		 438 aa  55.5  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  22.49 
 
 		 334 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  22.89 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  30.37 
 
 		 362 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.57 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.44 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0330  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.77 
 
 		 253 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0129199  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  22.93 
 
 		 657 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  24.77 
 
 		 468 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 335 aa  50.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  28.02 
 
 		 395 aa  50.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 365 aa  50.4  0.00006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  29.13 
 
 		 318 aa  50.4  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1523  DNA-cytosine methyltransferase  21.9 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00206279  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  22.22 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  23.97 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  27.62 
 
 		 437 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  26.04 
 
 		 421 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1487  DNA-cytosine methyltransferase  28.32 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2652  DNA-cytosine methyltransferase  22.96 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0989832  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.3 
 
 		 348 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  28.06 
 
 		 374 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  22.85 
 
 		 329 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.83 
 
 		 361 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4216  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.09 
 
 		 329 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.757892  normal  0.411127 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0576  DNA-cytosine methyltransferase  22.99 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1333  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 415 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.235826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 335 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  39.66 
 
 		 508 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  22.05 
 
 		 336 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  29.52 
 
 		 490 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  23.3 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  23.12 
 
 		 489 aa  46.6  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  25.11 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  23.47 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  21.83 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  24.34 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  28.67 
 
 		 657 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  21.96 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1413  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.582499  normal  0.117973 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  23.98 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4863  DNA-cytosine methyltransferase  28 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>