More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4172 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4172  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 416 aa  872    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.06239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1832  DNA-repair protein  47.96 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.375325 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3235  DNA-directed DNA polymerase  46.54 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3210  DNA-directed DNA polymerase  46.06 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000012227 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2196  DNA-directed DNA polymerase  47 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3453  DNA-directed DNA polymerase  45.58 
 
 		 418 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00650413  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0012  SOS mutagenesis protein RulB  44.63 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374057  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08269  DNA-directed DNA polymerase  45.5 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3553  DNA-directed DNA polymerase  45.35 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2605  DNA-directed DNA polymerase  45.8 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.733552  normal  0.0235112 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2040  DNA-directed DNA polymerase  47.49 
 
 		 418 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.939043  normal  0.0886472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4407  DNA-directed DNA polymerase  47.14 
 
 		 418 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4268  DNA-directed DNA polymerase  47.14 
 
 		 418 aa  358  7e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2171  DNA-directed DNA polymerase  45.82 
 
 		 417 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1964  DNA-directed DNA polymerase  43.91 
 
 		 418 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2195  DNA-directed DNA polymerase  45.32 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.147122  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4598  DNA-repair protein  44.36 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000181511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4414  DNA-repair protein  44.36 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000291737  decreased coverage  0.00359939 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4570  DNA-repair protein  44.36 
 
 		 418 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1636  umuC protein  42.86 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2682  umuC protein  42 
 
 		 418 aa  332  8e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2344  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 421 aa  331  1e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2466  DNA-repair protein  43.1 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0312138  normal  0.965014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1287  DNA polymerase V subunit UmuC  37.8 
 
 		 422 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000534988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1671  DNA polymerase V subunit UmuC  37.56 
 
 		 422 aa  280  3e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0525212  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01159  DNA polymerase V subunit UmuC  37.56 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000022565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2464  DNA-directed DNA polymerase  37.56 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1329  DNA polymerase V subunit UmuC  37.56 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01169  hypothetical protein  37.56 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000148835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2441  DNA polymerase V subunit UmuC  37.56 
 
 		 422 aa  280  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000365295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2120  DNA-repair protein  44.41 
 
 		 339 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1965  DNA polymerase V subunit UmuC  37.32 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000119892  normal  0.867639 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2212  DNA polymerase V subunit UmuC  36.84 
 
 		 422 aa  272  8.000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0650836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2162  DNA polymerase V subunit UmuC  37.32 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.229342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1982  DNA-directed DNA polymerase  37.26 
 
 		 423 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2215  DNA polymerase V subunit UmuC  37.08 
 
 		 422 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.69246  normal  0.844364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2158  DNA polymerase V subunit UmuC  37.08 
 
 		 422 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.512063  normal  0.695732 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0036  DNA polymerase V subunit UmuC  38.72 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0503759 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4000  DNA-directed DNA polymerase  38.3 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5030  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 		 426 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0002  DNA polymerase V subunit UmuC  39.05 
 
 		 423 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2458  DNA-directed DNA polymerase  35.85 
 
 		 424 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2342  DNA-directed DNA polymerase  35.85 
 
 		 424 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2005  DNA-directed DNA polymerase  35.85 
 
 		 424 aa  259  6e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000515421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2353  DNA-directed DNA polymerase  35.61 
 
 		 424 aa  257  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2606  DNA-directed DNA polymerase  36.75 
 
 		 422 aa  256  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.4458 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0053  mutagenesis and repair protein MucB  36.45 
 
 		 421 aa  256  6e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000259717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0705  DNA-directed DNA polymerase  35.08 
 
 		 450 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1751  umuC protein  37.35 
 
 		 427 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3841  DNA-directed DNA polymerase  35.56 
 
 		 437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1425  DNA-directed DNA polymerase  35.78 
 
 		 426 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4341  DNA-directed DNA polymerase  35.27 
 
 		 432 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4498  DNA-directed DNA polymerase  34.61 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2761  DNA-directed DNA polymerase  35.38 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0282343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2950  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4321  DNA-directed DNA polymerase  33.81 
 
 		 428 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0052  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 449 aa  241  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2745  DNA-directed DNA polymerase  34.19 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4983  UMUC-like DNA-repair protein  34.95 
 
 		 432 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000315583 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2106  DNA-directed DNA polymerase  35.7 
 
 		 421 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0886  DNA-directed DNA polymerase  33.65 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0175  DNA-directed DNA polymerase  34.2 
 
 		 423 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1279  DNA-directed DNA polymerase  35.29 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3075  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  34.53 
 
 		 419 aa  235  9e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0055  hypothetical protein  33.73 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.352875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1040  hypothetical protein  33.97 
 
 		 425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1369  DNA-directed DNA polymerase  35.45 
 
 		 426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1908  DNA-directed DNA polymerase  36.67 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1005  hypothetical protein  33.89 
 
 		 425 aa  232  7.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7046  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.81 
 
 		 442 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0220  DNA-directed DNA polymerase  33.17 
 
 		 436 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1550  DNA-directed DNA polymerase  32.7 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0477659 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1668  hypothetical protein  36.26 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1662  hypothetical protein  35.78 
 
 		 418 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3752  DNA-directed DNA polymerase  32.24 
 
 		 420 aa  219  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1492  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.41 
 
 		 420 aa  219  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00564635  decreased coverage  0.000128837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1369  DNA-directed DNA polymerase  33.25 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.772919  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2284  DNA-directed DNA polymerase  44.19 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.456765  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09231  putative UmuC protein  33.96 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.986725  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15961  putative UmuC protein  34.51 
 
 		 424 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09211  putative UmuC protein  33.96 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10658  putative RumB/ImpB like DNA repair protein  33.18 
 
 		 422 aa  216  8e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0862  DNA-directed DNA polymerase  33.88 
 
 		 428 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.826564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1434  DNA-directed DNA polymerase  34.48 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1292  DNA-directed DNA polymerase  34.03 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.355097  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6848  DNA-directed DNA polymerase  33.17 
 
 		 422 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615058  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2973  DNA-directed DNA polymerase  33.41 
 
 		 492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0296388  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0459  DNA-directed DNA polymerase  34.6 
 
 		 423 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.204967  normal  0.799613 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2378  DNA-directed DNA polymerase  32.94 
 
 		 425 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1335  DNA-directed DNA polymerase  31.89 
 
 		 419 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07071  putative UmuC protein  32.86 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.109713 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2200  DNA-directed DNA polymerase  33.64 
 
 		 424 aa  209  8e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1031  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0898  DNA-directed DNA polymerase  32.23 
 
 		 437 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.694521 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0759  DNA-directed DNA polymerase  32.55 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0859  DNA-directed DNA polymerase  32 
 
 		 450 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6255  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.983679 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1966  DNA-directed DNA polymerase  30.19 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.577995  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3536  DNA-repair protein  32.93 
 
 		 418 aa  199  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1338  umuC protein  31.43 
 
 		 432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>