More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4142 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4142  IS4 family transposase  100 
 
 
326 aa  686    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.282209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  84.38 
 
 
326 aa  577  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  84.38 
 
 
330 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  84.38 
 
 
330 aa  578  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  84.69 
 
 
326 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  84.06 
 
 
326 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  84.06 
 
 
326 aa  574  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02453  IS5 transposase  80.31 
 
 
326 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0522589  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01747  IS5 transposase  80.31 
 
 
326 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.548346  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  79.75 
 
 
326 aa  561  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  79.69 
 
 
326 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  79.75 
 
 
326 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  79.75 
 
 
326 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  57.61 
 
 
326 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  55.7 
 
 
327 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  56.65 
 
 
326 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  55.38 
 
 
338 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  55.02 
 
 
326 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  54.98 
 
 
314 aa  355  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  54.98 
 
 
314 aa  355  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  54.98 
 
 
314 aa  355  5e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  54.34 
 
 
326 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  56.27 
 
 
320 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1042  transposase, IS4 family protein  55.24 
 
 
317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.077617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1156  transposase, IS4 family protein  55.24 
 
 
317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2847  transposase IS4 family protein  55.24 
 
 
317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1714  transposase IS4 family protein  55.24 
 
 
317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  54.05 
 
 
326 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  54.29 
 
 
327 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  54.05 
 
 
326 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  54.05 
 
 
326 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  54.05 
 
 
326 aa  352  7e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  56.27 
 
 
326 aa  351  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  55.63 
 
 
327 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  55.63 
 
 
331 aa  351  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  55.31 
 
 
320 aa  348  7e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  53.4 
 
 
326 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  55.95 
 
 
405 aa  347  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  54.78 
 
 
329 aa  345  4e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  53.72 
 
 
321 aa  340  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>