28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4115 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  313  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  98.71 
 
 
155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  91.61 
 
 
155 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  88.39 
 
 
155 aa  249  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  81.94 
 
 
155 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  81.29 
 
 
155 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  61.29 
 
 
155 aa  183  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  56.77 
 
 
155 aa  183  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  54.36 
 
 
155 aa  166  7e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  50.32 
 
 
155 aa  157  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  59.06 
 
 
155 aa  153  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  54.36 
 
 
159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  54.78 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  34.46 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  32.89 
 
 
162 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  37.88 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  34.93 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  31.91 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  32.64 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  31.61 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  32.09 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  29.73 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  32.3 
 
 
153 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  30.09 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  31.21 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>