More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3929 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  95.32 
 
 		 663 aa  1306    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  51.23 
 
 		 652 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  52.68 
 
 		 652 aa  675    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  89.19 
 
 		 666 aa  1250    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  53.28 
 
 		 653 aa  723    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  88.89 
 
 		 666 aa  1246    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  88.89 
 
 		 666 aa  1247    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  100 
 
 		 663 aa  1362    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  89.04 
 
 		 666 aa  1248    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  89.64 
 
 		 666 aa  1254    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  48.31 
 
 		 658 aa  621  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  44.76 
 
 		 665 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  44.76 
 
 		 665 aa  558  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  44.76 
 
 		 665 aa  558  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  44.58 
 
 		 665 aa  557  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  43.42 
 
 		 655 aa  545  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  40.82 
 
 		 740 aa  493  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.91 
 
 		 656 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  44.15 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  38.94 
 
 		 700 aa  445  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  35.77 
 
 		 713 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  37.61 
 
 		 698 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 726 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  37.13 
 
 		 676 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  36.58 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  36.73 
 
 		 650 aa  392  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  36.58 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  36.58 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  36.26 
 
 		 656 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  37.03 
 
 		 659 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  36.28 
 
 		 650 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  36.51 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  36.51 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  36.51 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  36.51 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  36.13 
 
 		 663 aa  379  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  36.51 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  35.18 
 
 		 656 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  36.58 
 
 		 641 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  35.81 
 
 		 664 aa  369  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  35.1 
 
 		 702 aa  369  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  36.11 
 
 		 732 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 698 aa  363  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 698 aa  363  6e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 698 aa  363  6e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3636  TonB-dependent receptor  33.9 
 
 		 804 aa  355  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000134979  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  33.33 
 
 		 695 aa  351  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 715 aa  349  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  32.92 
 
 		 799 aa  347  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  33.48 
 
 		 799 aa  345  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.22 
 
 		 696 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  32.22 
 
 		 696 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 799 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  34.5 
 
 		 680 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 		 806 aa  333  4e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 714 aa  321  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  33.13 
 
 		 739 aa  319  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  29.15 
 
 		 704 aa  297  4e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 697 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 681 aa  289  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  32.75 
 
 		 653 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 661 aa  289  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  29.1 
 
 		 696 aa  288  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 635 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  29.81 
 
 		 696 aa  285  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 680 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 662 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 662 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 665 aa  278  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 649 aa  276  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 649 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  28.47 
 
 		 698 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  28.21 
 
 		 702 aa  274  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 649 aa  273  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 662 aa  272  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  31.07 
 
 		 640 aa  264  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 648 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 657 aa  230  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  29.71 
 
 		 744 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  29.49 
 
 		 744 aa  220  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  27.82 
 
 		 746 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  27.55 
 
 		 746 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  28.98 
 
 		 744 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  28.15 
 
 		 746 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2889  outer membrane receptor FepA  28.99 
 
 		 724 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2953  outer membrane receptor FepA  28.99 
 
 		 724 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246738  hitchhiker  0.000000000736095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2972  outer membrane receptor FepA  29.12 
 
 		 724 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0370731 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  29.52 
 
 		 724 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2919  outer membrane receptor FepA  29.24 
 
 		 724 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.91274  normal  0.0854265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 650 aa  206  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1450  outer membrane receptor FepA  29.1 
 
 		 740 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1839  outer membrane receptor FepA  28.19 
 
 		 703 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.228059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4579  outer membrane receptor FepA  27.02 
 
 		 742 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  26.18 
 
 		 742 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1195  outer membrane receptor FepA  27.53 
 
 		 749 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0821218  normal  0.246562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  26.89 
 
 		 751 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  26.89 
 
 		 751 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  26.89 
 
 		 751 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>