More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3850 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  428  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 220 aa  168  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2824  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 226 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3573  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2813  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2481  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5404  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0587042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 367 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 247 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 287 aa  52  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 126 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  21.76 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3377  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 232 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0130  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.943831  normal  0.482465 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  21.14 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  31.25 
 
 		 264 aa  48.1  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  21.23 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  21.99 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5235  transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4020  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.12217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  19.59 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0378  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.585496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2855  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00414349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>