49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3737 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3737  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  293  7e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000147329  hitchhiker  0.000000022613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0392  hypothetical protein  99.32 
 
 
148 aa  290  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000400952  unclonable  0.0000227076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4213  hypothetical protein  96.62 
 
 
148 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0493  hypothetical protein  95.27 
 
 
148 aa  263  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000306627  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0408  hypothetical protein  91.22 
 
 
148 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390387  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0419  hypothetical protein  91.22 
 
 
148 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000551607  unclonable  0.00000388194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0433  protein of unknown function DUF721  91.22 
 
 
148 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000320142  unclonable  0.00000000000179401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0407  hypothetical protein  91.22 
 
 
148 aa  256  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171569  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0361  hypothetical protein  75.68 
 
 
150 aa  221  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000115827  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4527  hypothetical protein  72.3 
 
 
150 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000460771  unclonable  0.0000000198081 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0416  hypothetical protein  72.3 
 
 
150 aa  218  3e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000379477  hitchhiker  0.000470097 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3805  hypothetical protein  71.62 
 
 
150 aa  215  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3447  hypothetical protein  75.68 
 
 
151 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000038127  unclonable  0.0000018391 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3798  hypothetical protein  72 
 
 
150 aa  184  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270613  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0360  hypothetical protein  70.27 
 
 
150 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000215067  unclonable  0.00000708625 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3585  hypothetical protein  35.47 
 
 
175 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3773  protein of unknown function DUF721  34.88 
 
 
175 aa  88.2  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2638  hypothetical protein  35.33 
 
 
155 aa  86.7  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0193906  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0655  protein of unknown function DUF721  34.18 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0240864  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0617  protein of unknown function DUF721  36.67 
 
 
174 aa  81.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000209759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0768  hypothetical protein  32.7 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000709717  normal  0.343025 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3511  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000118772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2911  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000130848  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3380  hypothetical protein  37.93 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000736191  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004484  hypothetical protein  31.06 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000519516  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0516  hypothetical protein  33.08 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.735657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1973  hypothetical protein  30.5 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00908  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4456  hypothetical protein  29.63 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0951  hypothetical protein  35.66 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166342  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4505  hypothetical protein  34.97 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  normal  0.62283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1344  hypothetical protein  34.97 
 
 
209 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.444258  decreased coverage  0.0000672782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4380  hypothetical protein  34.97 
 
 
209 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0506505  normal  0.0887943 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2000  protein of unknown function DUF721  30 
 
 
148 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372518  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4095  hypothetical protein  32.43 
 
 
161 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.332241  normal  0.566821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1154  hypothetical protein  30 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00206415  normal  0.301245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2183  hypothetical protein  33.1 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000427964  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4401  hypothetical protein  33.11 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3462  hypothetical protein  26.71 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000327193  hitchhiker  0.000142313 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0494  hypothetical protein  25.52 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402031  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1959  hypothetical protein  31.96 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0238  hypothetical protein  31.96 
 
 
100 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0647001  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2665  hypothetical protein  24 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202221  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2445  hypothetical protein  28.24 
 
 
149 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000170869  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2236  hypothetical protein  28.68 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000229139  normal  0.0987451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1433  Zn-ribbon-containing RNA-binding protein  31.65 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2828  hypothetical protein  26.98 
 
 
219 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.119045  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0929  hypothetical protein  32.62 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0092322  normal  0.674823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0005  protein of unknown function DUF721  41.67 
 
 
172 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.799003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>