More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3639 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  98.77 
 
 		 324 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  99.07 
 
 		 324 aa  650    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 324 aa  656    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  96.3 
 
 		 324 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  92.9 
 
 		 324 aa  590  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  91.98 
 
 		 324 aa  586  1e-166  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  91.67 
 
 		 324 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  91.67 
 
 		 324 aa  584  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  91.36 
 
 		 324 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  84.78 
 
 		 323 aa  511  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  82.3 
 
 		 323 aa  508  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  75 
 
 		 329 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  80.69 
 
 		 323 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  78.88 
 
 		 323 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  74.06 
 
 		 322 aa  464  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  59.68 
 
 		 326 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  60.44 
 
 		 324 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  57.23 
 
 		 326 aa  363  3e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  57.19 
 
 		 332 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  59.49 
 
 		 326 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  53.73 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  53.42 
 
 		 330 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  41.36 
 
 		 427 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  46.69 
 
 		 349 aa  236  3e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  43.52 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  40.06 
 
 		 326 aa  235  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  39.33 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  45.33 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  40.44 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  38.89 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  38.89 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  36.25 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  35.46 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  35.46 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  36.54 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  32.57 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  31.1 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  27.3 
 
 		 333 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  29.05 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  27.43 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.07 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1586  secretion protein HlyD family protein  27.19 
 
 		 328 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.125031  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.17 
 
 		 462 aa  96.3  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0700  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  27.43 
 
 		 335 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2446  secretion protein HlyD  26.21 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0391443  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2339  secretion protein HylD  27.81 
 
 		 357 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  26.3 
 
 		 335 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1902  secretion protein HlyD  25.71 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0432629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.92 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  29.2 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  26.24 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0499  secretion protein HlyD family protein  26.48 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.841099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  27.66 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8104  secretion protein HlyD family protein  25.57 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  27.5 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0971  secretion protein HlyD family protein  29.76 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.70003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  24.5 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3278  secretion protein HlyD family protein  29.41 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0564  secretion protein HlyD family protein  26.17 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  31.19 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  28.21 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4577  secretion protein HlyD  26.06 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.231546  normal  0.47776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2157  secretion protein HlyD family protein  28.34 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1744  secretion protein HlyD family protein  26.62 
 
 		 350 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0809  secretion protein HlyD family protein  27.94 
 
 		 351 aa  76.6  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0535  secretion protein HlyD family protein  27.08 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.482241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  26.35 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3445  secretion protein HlyD family protein  26.83 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.858033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1949  secretion protein HlyD family protein  27.92 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.262528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0168  secretion protein HlyD  29.66 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188471 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1480  secretion protein HlyD family protein  23.62 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.785095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.36 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  26.48 
 
 		 331 aa  73.9  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003314  multidrug resistance efflux pump  27 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  29.46 
 
 		 405 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  26.2 
 
 		 357 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  26.41 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3420  secretion protein HlyD family protein  29.44 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1056  multidrug resistance protein MdtN  29.73 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0333157  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2687  HlyD family secretion protein  26.32 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  27.43 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0351  secretion protein HlyD  24.91 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0760  secretion protein HlyD family protein  26.43 
 
 		 363 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.92181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0535  multidrug resistance protein MdtN  30.49 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03337  predicted HlyD family secretion protein  24.76 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0227  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0228  secretion protein HlyD family protein  24.76 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0596  multidrug resistance protein MdtN  30.49 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789434  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03289  hypothetical protein  24.76 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3776  MFP family transporter  24.76 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0866  multidrug resistance protein A  26.09 
 
 		 331 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4832  auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  25.56 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  26.96 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003056  multidrug resistance efflux pump  24.59 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1061  multidrug resistance protein MdtN  30.49 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.182652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>