235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3630 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  90.68 
 
 		 708 aa  1314    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  79.1 
 
 		 708 aa  1200    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3368  TonB-dependent receptor  56.36 
 
 		 717 aa  813    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  95.79 
 
 		 713 aa  1372    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  95.79 
 
 		 713 aa  1374    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  67.28 
 
 		 714 aa  986    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 713 aa  1478    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  78.26 
 
 		 713 aa  1189    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  79.24 
 
 		 713 aa  1207    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  62.89 
 
 		 701 aa  888    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  79.8 
 
 		 713 aa  1214    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  79.1 
 
 		 713 aa  1165    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  43.03 
 
 		 716 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  38.03 
 
 		 729 aa  452  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 769 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4299  TonB-dependent receptor  39.04 
 
 		 766 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.570809  normal  0.101344 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  37.52 
 
 		 793 aa  432  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 766 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  38.87 
 
 		 741 aa  429  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0422  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 744 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.328306  normal  0.298969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 750 aa  422  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2688  TonB-dependent receptor protein  35.72 
 
 		 772 aa  416  9.999999999999999e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.96874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2193  TonB-dependent receptor  36.54 
 
 		 780 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.968767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 721 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  36.75 
 
 		 758 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  35.91 
 
 		 767 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0965  TonB-dependent receptor  34.23 
 
 		 773 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.195804  normal  0.489685 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  33.99 
 
 		 775 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 718 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 685 aa  188  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03808  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 705 aa  165  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 749 aa  159  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 705 aa  141  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 681 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 698 aa  125  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 697 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  23.79 
 
 		 695 aa  110  8.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  23.26 
 
 		 668 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 768 aa  101  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 		 673 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  23.1 
 
 		 668 aa  100  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  23.54 
 
 		 719 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  23.32 
 
 		 723 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  24.05 
 
 		 698 aa  97.8  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  23.33 
 
 		 662 aa  97.4  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 		 668 aa  97.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 668 aa  95.9  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  23.9 
 
 		 725 aa  95.1  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  22.49 
 
 		 687 aa  93.2  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 706 aa  93.6  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  21.11 
 
 		 696 aa  92.8  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 702 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  23.66 
 
 		 686 aa  87.8  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 702 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  22.51 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1804  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 683 aa  85.9  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0894155  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  22.76 
 
 		 676 aa  84.7  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  21.83 
 
 		 702 aa  84  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  22.61 
 
 		 676 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  24.14 
 
 		 699 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  21.93 
 
 		 726 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  20.98 
 
 		 724 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 699 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  22.19 
 
 		 688 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  23.09 
 
 		 681 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 680 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  23.13 
 
 		 681 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 685 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  22.97 
 
 		 686 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 672 aa  75.5  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  21.02 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0185  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  26.01 
 
 		 728 aa  73.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848528 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  20.38 
 
 		 687 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  21.02 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  21.02 
 
 		 710 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 682 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  27.52 
 
 		 691 aa  71.6  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  21.92 
 
 		 667 aa  71.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  22.58 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  23.09 
 
 		 687 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  23.77 
 
 		 687 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 684 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  24.31 
 
 		 719 aa  68.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  20.22 
 
 		 709 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  21.58 
 
 		 710 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  24.83 
 
 		 687 aa  67.8  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  19.65 
 
 		 749 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  19.65 
 
 		 749 aa  67.4  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 709 aa  67  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 705 aa  67  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  21.89 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  23.08 
 
 		 667 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 661 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  26.56 
 
 		 661 aa  65.1  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  21.66 
 
 		 735 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  21.09 
 
 		 625 aa  64.3  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  20 
 
 		 760 aa  63.9  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  20.51 
 
 		 710 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  22.7 
 
 		 676 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>