More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3611 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.8 
 
 
633 aa  971    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.65 
 
 
633 aa  967    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  82.33 
 
 
634 aa  1040    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  93.06 
 
 
634 aa  1168    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.96 
 
 
633 aa  973    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
634 aa  1289    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  81.8 
 
 
633 aa  946    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.61 
 
 
638 aa  723    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 
637 aa  524  1e-147  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 
636 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
637 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 
541 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  46.28 
 
 
712 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  46.01 
 
 
712 aa  300  8e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.87 
 
 
552 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1479  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 
640 aa  295  2e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0522747  normal  0.0374393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  46.02 
 
 
713 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.03 
 
 
564 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.02 
 
 
716 aa  293  9e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.16 
 
 
674 aa  292  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.35 
 
 
541 aa  290  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.41 
 
 
555 aa  288  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.04 
 
 
653 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  41.87 
 
 
559 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 
619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
638 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
548 aa  281  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  49.25 
 
 
561 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.84 
 
 
640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
639 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
688 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  49.24 
 
 
561 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.02 
 
 
640 aa  273  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.94 
 
 
626 aa  272  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.26 
 
 
650 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  45.85 
 
 
714 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 
628 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
714 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  46.15 
 
 
688 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  40.86 
 
 
643 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  46.42 
 
 
715 aa  270  5e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.62 
 
 
714 aa  270  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  43.75 
 
 
629 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.59 
 
 
628 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  44.8 
 
 
647 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.58 
 
 
688 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.92 
 
 
640 aa  267  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.66 
 
 
560 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
638 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.41 
 
 
688 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
552 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
638 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.47 
 
 
638 aa  264  3e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
714 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
638 aa  264  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  47.04 
 
 
560 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
714 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44 
 
 
639 aa  263  6e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
645 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
540 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.59 
 
 
634 aa  262  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
642 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  44.8 
 
 
647 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  42.82 
 
 
633 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  43.91 
 
 
642 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  43.91 
 
 
546 aa  261  4e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.19 
 
 
636 aa  259  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
619 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
773 aa  258  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  43.3 
 
 
541 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  36.16 
 
 
545 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.28 
 
 
438 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
411 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  40.96 
 
 
626 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
638 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  44.48 
 
 
554 aa  257  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 
638 aa  256  8e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  45.01 
 
 
738 aa  256  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
639 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  45.33 
 
 
650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  42.45 
 
 
541 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.67 
 
 
626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  42.9 
 
 
545 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000194984 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  43.57 
 
 
695 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
545 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 
639 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.9 
 
 
545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
554 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4454  methyl-accepting chemotaxis protein  47.04 
 
 
642 aa  254  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  40.58 
 
 
639 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 
570 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
544 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  38.78 
 
 
549 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
425 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
544 aa  254  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  42.24 
 
 
558 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.41 
 
 
639 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
544 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
546 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>