21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3542 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3542  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  555  1e-157  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0582  hypothetical protein  73.48 
 
 		 275 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3371  hypothetical protein  73.38 
 
 		 275 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0694  hypothetical protein  57.81 
 
 		 271 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0663  hypothetical protein  57.81 
 
 		 266 aa  315  6e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0684  hypothetical protein  57.81 
 
 		 271 aa  315  7e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0736  hypothetical protein  52.8 
 
 		 264 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0838  hypothetical protein  34.01 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.14986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3568  hypothetical protein  29.41 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.550402  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1295  hypothetical protein  31.96 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.634955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1907  hypothetical protein  31.44 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.392589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0388  hypothetical protein  26.8 
 
 		 274 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.333934 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2944  hypothetical protein  26.53 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0809  hypothetical protein  24.62 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0426  hypothetical protein  23.65 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3148  hypothetical protein  24.24 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0494985  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0053  hypothetical protein  23.33 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1461  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.617285  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2231  hypothetical protein  21.5 
 
 		 274 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2636  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3081  hypothetical protein  25.12 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0257999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>