More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3333 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3333  methyltransferase small  100 
 
 
241 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3230  methyltransferase small  83.4 
 
 
236 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0793  methyltransferase small  83.4 
 
 
236 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  71.11 
 
 
220 aa  331  6e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0888  methyltransferase type 12  64.32 
 
 
238 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3526  methyltransferase small  60 
 
 
238 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3645  methyltransferase small  58.75 
 
 
238 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0841  methyltransferase small  57.92 
 
 
238 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3451  methyltransferase type 12  57.92 
 
 
238 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0768  methyltransferase small  53.09 
 
 
243 aa  255  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0650188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0661  methyltransferase small  52.19 
 
 
251 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0803  methyltransferase small  50 
 
 
264 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0893  methyltransferase small  50.41 
 
 
243 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.298373  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0891  methyltransferase small  49.8 
 
 
244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0196039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2741  hypothetical protein  49.79 
 
 
247 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0745  O-methyltransferase  46.42 
 
 
265 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0559  hypothetical protein  43.98 
 
 
234 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.988646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0999  methyltransferase small  42.56 
 
 
240 aa  176  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00953  hypothetical protein  42.74 
 
 
239 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0192  hypothetical protein  42.8 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02469  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.768182  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1093  methyltransferase small  41.67 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2727  putative methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0720912  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02433  hypothetical protein  41.67 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.985582  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2731  putative methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.606745  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1102  methyltransferase small  41.67 
 
 
245 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0616401  normal  0.747552 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2861  putative methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  169  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00609707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  41 
 
 
248 aa  168  6e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2942  putative methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004444  predicted O-methyltransferase  43.67 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3811  putative methyltransferase  40.42 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0204318  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3079  methyltransferase small  42.15 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0861155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1060  methyltransferase small  39.26 
 
 
265 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00210052  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3678  methyltransferase small  39.58 
 
 
260 aa  161  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121234  normal  0.182138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0325  methyltransferase small  38.11 
 
 
239 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.106139  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1296  SAM-dependent methyltransferase  36.1 
 
 
236 aa  159  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3062  methyltransferase small  38.33 
 
 
245 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.501709  hitchhiker  0.000223142 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1299  methyltransferase small  35.27 
 
 
235 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04650  hypothetical protein  37.34 
 
 
236 aa  154  2e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2793  methyltransferase small  36.93 
 
 
248 aa  150  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00912632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  36.93 
 
 
252 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  36.93 
 
 
248 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  36.93 
 
 
248 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2972  methyltransferase small  35.98 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.982208  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3373  methyltransferase small  36.14 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0772935  normal  0.241252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5119  methyltransferase small  34.44 
 
 
240 aa  133  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_002950  PG1104  hypothetical protein  35.12 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2705  SAM-dependent methyltransferase  32.79 
 
 
238 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3970  methyltransferase small  31.92 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00784  putative RNA methyltransferase  30.5 
 
 
253 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2411  methyltransferase small  31.34 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.347035  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  28.76 
 
 
246 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  28.32 
 
 
246 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  29.41 
 
 
249 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  28.44 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  28.76 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  28 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  28 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  28.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  28.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  28.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  28.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  28.32 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  23.5 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  24.42 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  28.7 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  27.78 
 
 
228 aa  73.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.55 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  24.02 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  24.54 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  23.7 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  22.65 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  27.64 
 
 
252 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  26.8 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  29.05 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  29.41 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  29.41 
 
 
253 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.65 
 
 
240 aa  63.2  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  23.38 
 
 
263 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  22.71 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  26.2 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  27.75 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2938  methyltransferase small  24.83 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  22.58 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  27.42 
 
 
271 aa  59.7  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  23.5 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  23.78 
 
 
251 aa  58.9  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  26.99 
 
 
235 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  22.41 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  28.05 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  27.4 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  23.45 
 
 
258 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  27.52 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  29.61 
 
 
241 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  21.98 
 
 
233 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  21.98 
 
 
233 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  21.08 
 
 
330 aa  55.8  0.0000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  23.08 
 
 
256 aa  55.5  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  26.85 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>