More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3300 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0986  chromate transporter, putative  88.95 
 
 		 390 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0823  chromate transporter  90.77 
 
 		 390 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000162032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3200  chromate transporter  91.28 
 
 		 390 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3300  chromate transporter  100 
 
 		 390 aa  761    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3053  chromate transporter  80.95 
 
 		 383 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0869  chromate transporter  81.68 
 
 		 382 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.359276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3423  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  81.27 
 
 		 418 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3618  chromate transporter  81.27 
 
 		 418 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.927758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3495  chromate transporter  80.21 
 
 		 418 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0753  chromate transporter  64.6 
 
 		 395 aa  488  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3160  chromate transporter  66.31 
 
 		 383 aa  490  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.24892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0936  chromate transporter  63.61 
 
 		 386 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00735858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  61.62 
 
 		 383 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0672  putative chromate transporter  55.74 
 
 		 383 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.33895  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0802  chromate transporter  53.73 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0636  chromate transporter  57.26 
 
 		 381 aa  356  5e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.99699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  52.91 
 
 		 378 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03341  hypothetical protein  52.77 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1918  putative transporter  55.52 
 
 		 380 aa  338  5.9999999999999996e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002654  chromate transport protein ChrA  53.58 
 
 		 379 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3884  chromate resistance protein-related protein  52.3 
 
 		 387 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.849699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0756  chromate transporter  47.07 
 
 		 404 aa  309  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.962008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  45.48 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  45.4 
 
 		 388 aa  266  5e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  43.51 
 
 		 401 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  43.72 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  43.72 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  43.72 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  43.18 
 
 		 403 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  44.66 
 
 		 425 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  42.56 
 
 		 402 aa  257  2e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55740  putative transporter  45.69 
 
 		 401 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  43.72 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.78 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  43.46 
 
 		 401 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  43.43 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  40.37 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.69 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.69 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  44.39 
 
 		 413 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  43.9 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4310  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.04 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.660364  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4420  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.04 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.382281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  42.75 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4856  putative transporter  45.36 
 
 		 401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  43.13 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  41.18 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  40.16 
 
 		 393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  40.97 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2449  chromate transporter  41.69 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292465  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  41.58 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  41.65 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  41.58 
 
 		 393 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  41.84 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000101188 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  43.96 
 
 		 403 aa  235  9e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  40.87 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  43.41 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  41.32 
 
 		 393 aa  233  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  41.1 
 
 		 393 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2824  chromate transporter  43.56 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0473145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  41.84 
 
 		 393 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  41.89 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5777  chromate transporter  43.83 
 
 		 412 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.7 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  44.01 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  44.01 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4831  putative chromate transporter  40.05 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.162122  normal  0.0286905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1796  chromate transporter  40.71 
 
 		 396 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  42.01 
 
 		 409 aa  223  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1857  chromate transporter  41.97 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.57 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0957  chromate transporter  42.13 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.29904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  42.48 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0083  chromate transporter  41.08 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1976  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  40.99 
 
 		 400 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.884111  normal  0.125036 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  39.39 
 
 		 392 aa  213  5.999999999999999e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2282  chromate efflux pump, ChrA  41.45 
 
 		 392 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.122338  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  40.59 
 
 		 394 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1101  chromate transporter  43.24 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2441  chromate transporter  39.94 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0729076  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  41.96 
 
 		 405 aa  210  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  43.84 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  44.48 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  40.99 
 
 		 346 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1844  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  42.31 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1773  chromate transporter  40.55 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0287413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0499  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  41.67 
 
 		 404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0769202  normal  0.0119289 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1930  chromate transporter  39.93 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1209  chromate transporter  41.71 
 
 		 416 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  28.35 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48511  predicted protein  29.37 
 
 		 493 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.7 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0860  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  48.73 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.757258  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1603  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.29 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.312378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3423  chromate transporter, permease component  30.68 
 
 		 400 aa  126  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.65 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89366  CHR family transporter: chromate ion  29.76 
 
 		 476 aa  122  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0609883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.83 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.24 
 
 		 392 aa  119  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1000  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.65 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>