98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3289 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  100 
 
 
770 aa  1578    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  87.4 
 
 
770 aa  1396    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  45.5 
 
 
768 aa  686    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  78.96 
 
 
770 aa  1291    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  78.96 
 
 
770 aa  1290    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  95.05 
 
 
769 aa  1509    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  78.83 
 
 
770 aa  1287    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  55.12 
 
 
772 aa  856    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  57.61 
 
 
769 aa  896    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  79.22 
 
 
770 aa  1291    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  94.53 
 
 
769 aa  1500    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  24.67 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  25.88 
 
 
519 aa  120  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.24 
 
 
530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  29.1 
 
 
621 aa  114  7.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.42 
 
 
291 aa  107  7e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  29.68 
 
 
449 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  29.83 
 
 
332 aa  97.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  28.4 
 
 
454 aa  94.7  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  25.4 
 
 
829 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  24.03 
 
 
534 aa  85.9  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  25.4 
 
 
829 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  24.6 
 
 
828 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  25.17 
 
 
829 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  24.41 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  24.21 
 
 
720 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  24.21 
 
 
720 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  25.36 
 
 
759 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  23.9 
 
 
720 aa  78.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.52 
 
 
274 aa  77  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  25.06 
 
 
818 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  25.39 
 
 
757 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25.77 
 
 
755 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  28.12 
 
 
173 aa  74.7  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.71 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  23.42 
 
 
566 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  25 
 
 
755 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.33 
 
 
722 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.33 
 
 
722 aa  73.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  23.66 
 
 
566 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  26.06 
 
 
722 aa  72  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  25.33 
 
 
300 aa  72  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  26.06 
 
 
722 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  23.85 
 
 
566 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  28.33 
 
 
175 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  24.32 
 
 
197 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  25.23 
 
 
746 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  31.69 
 
 
203 aa  70.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  24.29 
 
 
838 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  23.27 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  27.22 
 
 
238 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.35 
 
 
580 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  31.37 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  24.29 
 
 
838 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  24.29 
 
 
838 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  25.78 
 
 
175 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  24.55 
 
 
226 aa  65.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  32.14 
 
 
178 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  24.34 
 
 
816 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  30.72 
 
 
178 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  25.39 
 
 
566 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  24.16 
 
 
816 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  24.75 
 
 
577 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.27 
 
 
566 aa  63.5  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  23.15 
 
 
602 aa  63.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  23.37 
 
 
566 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  23.83 
 
 
571 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  23.36 
 
 
836 aa  62.8  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  24.5 
 
 
577 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  25 
 
 
577 aa  62  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  23.97 
 
 
816 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  23.22 
 
 
566 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  22.84 
 
 
566 aa  60.5  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  25.29 
 
 
240 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  23.93 
 
 
576 aa  59.3  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  25.95 
 
 
239 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  25.37 
 
 
580 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  21.41 
 
 
424 aa  58.5  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  25.12 
 
 
576 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  31.73 
 
 
171 aa  57.4  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  24.88 
 
 
576 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  25.44 
 
 
576 aa  56.2  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  29.41 
 
 
108 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  28.26 
 
 
188 aa  53.9  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  25.2 
 
 
134 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  25.84 
 
 
614 aa  53.9  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  31.13 
 
 
203 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  30.37 
 
 
181 aa  51.2  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  22.69 
 
 
230 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.31 
 
 
590 aa  48.1  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  31.36 
 
 
351 aa  48.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  23.83 
 
 
577 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  27.34 
 
 
180 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  25.49 
 
 
187 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  29.37 
 
 
357 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
351 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0610  hypothetical protein  37.68 
 
 
262 aa  44.3  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.144689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  22.99 
 
 
159 aa  43.9  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>