159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2794 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2794  putative hydrolase  100 
 
 		 252 aa  519  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2619  putative hydrolase  98.81 
 
 		 252 aa  513  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000339322 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2686  putative hydrolase  98.02 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.796861  unclonable  0.000044786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1652  putative hydrolase  91.6 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1472  putative hydrolase  87.6 
 
 		 254 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.855662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1467  putative hydrolase  87.6 
 
 		 254 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2880  putative hydrolase  88 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014614 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1503  putative hydrolase  88 
 
 		 254 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1369  putative hydrolase  86.85 
 
 		 251 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.979942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2233  putative hydrolase  74.9 
 
 		 251 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2939  putative hydrolase  77.64 
 
 		 246 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1706  putative hydrolase  73.75 
 
 		 249 aa  391  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.946189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3709  putative hydrolase  73.33 
 
 		 248 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000275833  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1420  putative hydrolase  71.67 
 
 		 247 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0157701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1436  putative hydrolase  74.7 
 
 		 260 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1798  putative hydrolase  64.34 
 
 		 245 aa  337  9e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00489097  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2075  putative hydrolase  63.93 
 
 		 245 aa  337  9e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.674909  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2280  putative hydrolase  63.16 
 
 		 245 aa  331  8e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2053  putative hydrolase  62.3 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1934  putative hydrolase  65.16 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000352911  hitchhiker  0.00478063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2165  putative hydrolase  62.3 
 
 		 245 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.213486  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2185  putative hydrolase  61.13 
 
 		 245 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2446  putative hydrolase  62.3 
 
 		 245 aa  326  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1550  putative hydrolase  61.54 
 
 		 245 aa  316  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115806  normal  0.103219 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2611  PHP domain protein  62.7 
 
 		 245 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000586023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1247  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  311  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.428207 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1232  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2054  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0675001  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2237  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.616812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1202  putative hydrolase  61.48 
 
 		 245 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.499056  normal  0.794104 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01031  hypothetical protein  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01038  hypothetical protein  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1152  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0656771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2565  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155213 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2099  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.95835 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2295  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.31426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1412  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  304  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0615585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1153  putative hydrolase  63.11 
 
 		 245 aa  304  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0316  putative hydrolase  57.26 
 
 		 244 aa  293  2e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1060  putative hydrolase  50.21 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.464705  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001417  histidinol phosphatase  48.4 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0111  putative hydrolase  50.89 
 
 		 241 aa  237  2e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0887  putative hydrolase  47.77 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001195  histidinol phosphatase  45.23 
 
 		 251 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3868  putative hydrolase  46.91 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0341145  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0344  putative hydrolase  46 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00676194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04983  putative hydrolase  44.44 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2028  PHP domain protein  42.02 
 
 		 238 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.731698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2292  putative hydrolase  41.7 
 
 		 239 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4253  putative hydrolase  43.35 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2491  putative hydrolase  42.06 
 
 		 248 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.130978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2586  putative hydrolase  43.35 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0073149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0620  putative hydrolase  40.68 
 
 		 240 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000619827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4017  putative hydrolase  42.74 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59903e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19230  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  42.26 
 
 		 239 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0261596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3933  putative hydrolase  42.31 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00241921  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0657  PHP domain protein  38.63 
 
 		 235 aa  181  8.000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1950  putative hydrolase  39.11 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0627  phosphotransferase domain-containing protein  36.29 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000135059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3779  PHP domain protein  33.76 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.262487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0063  phosphotransferase domain-containing protein  32.03 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1177  phosphotransferase domain-containing protein  32.94 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.133886  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0109  PHP domain protein  28.12 
 
 		 270 aa  108  7.000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.165533 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3942  PHP domain protein  28.57 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000108896  normal  0.54969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15900  PHP domain protein  28.02 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00203207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  30.39 
 
 		 573 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  30.9 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  30.69 
 
 		 584 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  27.54 
 
 		 574 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  28.22 
 
 		 579 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  28.57 
 
 		 574 aa  72.4  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  29.86 
 
 		 577 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  31.4 
 
 		 580 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  26.57 
 
 		 578 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  30.24 
 
 		 557 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0459  phosphotransferase domain-containing protein  33.94 
 
 		 586 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  33.73 
 
 		 586 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  25.93 
 
 		 578 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  25.31 
 
 		 598 aa  65.9  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  30.69 
 
 		 570 aa  65.5  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  29.05 
 
 		 335 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  27.49 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  29.9 
 
 		 580 aa  63.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  29.08 
 
 		 543 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  26.03 
 
 		 594 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  26.03 
 
 		 578 aa  63.5  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  27.83 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2025  PHP domain protein  22.02 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  27.6 
 
 		 347 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  26.54 
 
 		 588 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  29.95 
 
 		 580 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  29 
 
 		 570 aa  62.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  31.86 
 
 		 570 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  28.45 
 
 		 560 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  26.17 
 
 		 381 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  28.23 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  30.88 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  28.71 
 
 		 583 aa  60.1  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  28.08 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  27.2 
 
 		 614 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>