109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2787 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  88.44 
 
 
758 aa  1321  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  100 
 
 
762 aa  1564  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  56.5 
 
 
755 aa  819  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  95.8 
 
 
762 aa  1440  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  82.11 
 
 
764 aa  1238  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  95.14 
 
 
762 aa  1457  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  82.83 
 
 
761 aa  1244  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  47.59 
 
 
766 aa  635  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  82.57 
 
 
761 aa  1241  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  82.11 
 
 
764 aa  1238  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  47.74 
 
 
764 aa  654  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  81.57 
 
 
765 aa  1234  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  46.79 
 
 
770 aa  605  1e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  26.83 
 
 
656 aa  126  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  26.06 
 
 
639 aa  127  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.48 
 
 
639 aa  127  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.15 
 
 
789 aa  124  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  24.2 
 
 
789 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25.68 
 
 
639 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  26.9 
 
 
646 aa  120  1e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  25.49 
 
 
639 aa  118  4e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  24.6 
 
 
788 aa  117  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  25.36 
 
 
639 aa  117  7e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  24.53 
 
 
778 aa  117  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  25.1 
 
 
639 aa  115  2e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  23.98 
 
 
639 aa  112  2e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  25.18 
 
 
788 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  24.13 
 
 
667 aa  111  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  23.61 
 
 
653 aa  110  8e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  23.85 
 
 
639 aa  109  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  23.55 
 
 
895 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  25.52 
 
 
885 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  23.72 
 
 
639 aa  108  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  26.39 
 
 
820 aa  107  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  25 
 
 
650 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  24.87 
 
 
650 aa  103  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  25.1 
 
 
650 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  26.46 
 
 
826 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  25.13 
 
 
650 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  25.45 
 
 
639 aa  102  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  25.1 
 
 
650 aa  102  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  25 
 
 
650 aa  101  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  23.68 
 
 
745 aa  97.4  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  24.31 
 
 
782 aa  96.3  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  35.23 
 
 
898 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  35.75 
 
 
898 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  24.67 
 
 
809 aa  94.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  34.72 
 
 
898 aa  94.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  24.18 
 
 
655 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  23.57 
 
 
671 aa  91.3  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  28.57 
 
 
742 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  24.4 
 
 
656 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  23.94 
 
 
640 aa  86.3  2e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  24.37 
 
 
816 aa  85.5  3e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  23.99 
 
 
663 aa  85.9  3e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  27.55 
 
 
742 aa  85.1  4e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.8 
 
 
742 aa  84.7  6e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  23.16 
 
 
729 aa  84  1e-14  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  29.26 
 
 
945 aa  79.3  2e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  24.69 
 
 
716 aa  78.6  4e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  23.97 
 
 
936 aa  78.2  6e-13  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  26.77 
 
 
762 aa  77.8  7e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  22.49 
 
 
671 aa  77.8  7e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  24.69 
 
 
741 aa  77.8  7e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  24.36 
 
 
720 aa  77.4  1e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.5 
 
 
731 aa  75.1  4e-12  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  23.06 
 
 
660 aa  74.7  5e-12  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  23.2 
 
 
725 aa  73.6  1e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  30.8 
 
 
822 aa  73.2  2e-11  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.3 
 
 
727 aa  70.5  1e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  22.82 
 
 
722 aa  70.1  1e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  27.98 
 
 
833 aa  69.7  2e-10  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  27.8 
 
 
843 aa  69.7  2e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  23.11 
 
 
719 aa  68.6  5e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  22.95 
 
 
754 aa  67.4  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  23.05 
 
 
724 aa  64.7  7e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  22.7 
 
 
714 aa  63.9  1e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  31.38 
 
 
642 aa  62.8  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  30.16 
 
 
700 aa  63.2  2e-08  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  24.91 
 
 
857 aa  61.6  5e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  34 
 
 
677 aa  59.7  2e-07  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  22.58 
 
 
738 aa  59.7  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  34 
 
 
657 aa  58.2  6e-07  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  23.92 
 
 
856 aa  57  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2862  hypothetical protein  29.03 
 
 
698 aa  57.4  1e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  35 
 
 
680 aa  57.4  1e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  30 
 
 
696 aa  56.2  2e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1515  hypothetical protein  29.03 
 
 
701 aa  56.2  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2843  hypothetical protein  29.03 
 
 
701 aa  56.2  2e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  30 
 
 
696 aa  56.2  2e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2991  hypothetical protein  29.03 
 
 
701 aa  56.2  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  22.03 
 
 
724 aa  55.8  3e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  21.74 
 
 
729 aa  54.3  8e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  37.89 
 
 
612 aa  53.1  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  24.87 
 
 
785 aa  53.1  2e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  29.19 
 
 
757 aa  52  4e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  23.95 
 
 
741 aa  51.6  5e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  37 
 
 
687 aa  51.6  6e-05  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  29.38 
 
 
655 aa  50.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  23.24 
 
 
730 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>