167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2696 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  98.01 
 
 
452 aa  874    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  97.79 
 
 
452 aa  849    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  100 
 
 
452 aa  888    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  67.05 
 
 
438 aa  570  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  59.31 
 
 
441 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  57.67 
 
 
437 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  60.24 
 
 
443 aa  496  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  55.04 
 
 
426 aa  456  1e-127  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  50.56 
 
 
446 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  51.13 
 
 
432 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  51.13 
 
 
432 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  50.9 
 
 
432 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  50.9 
 
 
432 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  49.44 
 
 
433 aa  386  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  51.58 
 
 
435 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  51.58 
 
 
432 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  51.58 
 
 
432 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  50 
 
 
432 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  51.58 
 
 
432 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  49.78 
 
 
435 aa  382  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  48.39 
 
 
433 aa  378  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  50.11 
 
 
434 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  50.59 
 
 
418 aa  350  3e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  44.39 
 
 
444 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  44.26 
 
 
419 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  42.36 
 
 
440 aa  340  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  44.68 
 
 
429 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  43.91 
 
 
441 aa  332  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  42.11 
 
 
431 aa  323  5e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  44.57 
 
 
408 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  41.32 
 
 
438 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  43.87 
 
 
406 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  46.21 
 
 
413 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  45.01 
 
 
429 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  44.34 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  44.84 
 
 
407 aa  302  8.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  41 
 
 
429 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  44.42 
 
 
430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  40.77 
 
 
429 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  34.48 
 
 
1140 aa  216  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  33.93 
 
 
435 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.98 
 
 
432 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  32.02 
 
 
436 aa  189  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  33.86 
 
 
427 aa  187  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  35.43 
 
 
426 aa  186  8e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  30.94 
 
 
417 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.26 
 
 
417 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.53 
 
 
410 aa  183  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.49 
 
 
431 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  33.41 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  31.07 
 
 
425 aa  180  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  31.09 
 
 
417 aa  180  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  35.76 
 
 
426 aa  180  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  32.41 
 
 
428 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
423 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
423 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  34.8 
 
 
428 aa  177  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 
423 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  33.02 
 
 
423 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 
423 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 
423 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  33.02 
 
 
423 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  33.18 
 
 
415 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.33 
 
 
421 aa  176  6e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  31.36 
 
 
428 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  34.18 
 
 
425 aa  176  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  32.55 
 
 
424 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  32.32 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  32.23 
 
 
424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  33.1 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  31.54 
 
 
431 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  32.15 
 
 
407 aa  173  6.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  32.59 
 
 
423 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  31.1 
 
 
431 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.1 
 
 
431 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  32.42 
 
 
420 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  30.84 
 
 
435 aa  169  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  30.8 
 
 
440 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  34.13 
 
 
389 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  32.17 
 
 
421 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  31.35 
 
 
403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  32.28 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  30.32 
 
 
412 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  30.32 
 
 
436 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  30.62 
 
 
458 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  33.26 
 
 
437 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04150  glucose/galactose transporter protein  30.49 
 
 
429 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.311164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4565  major facilitator transporter  28.82 
 
 
488 aa  141  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178249  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0562  glucose/galactose transporter  31.17 
 
 
413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0364  glucose/galactose transporter family protein  30.86 
 
 
408 aa  137  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000442276  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  27.16 
 
 
471 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  29.65 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3386  glucose/galactose transporter  30.77 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  28.64 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1827  glucose/galactose transporter  30.16 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30.24 
 
 
433 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1551  L-fucose transporter  30.05 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1324  glucose/galactose transporter  29.81 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.927631  normal  0.568114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  26 
 
 
438 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  26 
 
 
438 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>