More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2693 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
278 aa  581  1e-165  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  98.92 
 
 
278 aa  574  1e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  98.92 
 
 
278 aa  575  1e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  91.37 
 
 
278 aa  534  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  87.77 
 
 
278 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  88.13 
 
 
278 aa  510  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  87.05 
 
 
278 aa  504  1e-142  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  87.05 
 
 
278 aa  504  1e-142  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  87.77 
 
 
271 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  68.54 
 
 
279 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  68.27 
 
 
312 aa  386  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  64.66 
 
 
277 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  62.45 
 
 
275 aa  358  4e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  62.08 
 
 
275 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  57.78 
 
 
278 aa  336  2e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  49.81 
 
 
277 aa  284  1e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  50.19 
 
 
280 aa  279  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  50.78 
 
 
278 aa  254  1e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  47.58 
 
 
278 aa  244  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  49.61 
 
 
278 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 
274 aa  222  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  40.29 
 
 
278 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 
279 aa  188  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 
281 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 
281 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  39.64 
 
 
284 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
277 aa  179  3e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 
277 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  36.86 
 
 
284 aa  174  2e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  36.12 
 
 
276 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
276 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  36.05 
 
 
264 aa  164  2e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  32.71 
 
 
276 aa  162  4e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.65121e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
275 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  34.44 
 
 
283 aa  159  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 
355 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
259 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
275 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 
300 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 
300 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  7.86642e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 
273 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  34.87 
 
 
284 aa  153  3e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
303 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  31.42 
 
 
278 aa  148  1e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  2.96813e-06 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
306 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
306 aa  147  2e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  2.2105e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 
275 aa  146  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 
274 aa  146  4e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 
277 aa  145  7e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
306 aa  145  8e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  36.29 
 
 
264 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  33.2 
 
 
275 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  34.73 
 
 
284 aa  140  2e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 
277 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 
280 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.09 
 
 
273 aa  139  4e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  35.25 
 
 
266 aa  139  4e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  34.73 
 
 
284 aa  139  5e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 
280 aa  139  5e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 
280 aa  139  5e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  33.84 
 
 
280 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  34.09 
 
 
268 aa  138  9e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  31.48 
 
 
432 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 
268 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 
299 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  2.59018e-07  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
276 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
276 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  31.23 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 
276 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2811  transcriptional regulator, AraC family  32.96 
 
 
303 aa  136  3e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
432 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2552  transcriptional regulator, AraC family  32.41 
 
 
288 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974489  normal  0.68822 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
432 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
432 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
432 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  32.57 
 
 
275 aa  135  6e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 
285 aa  134  1e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5531  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
264 aa  134  2e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 
277 aa  134  2e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  32.82 
 
 
276 aa  134  2e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  32.33 
 
 
278 aa  132  4e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 
273 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
282 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  29.69 
 
 
282 aa  132  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  34.35 
 
 
273 aa  131  1e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  32.3 
 
 
281 aa  131  1e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  37.3 
 
 
264 aa  130  2e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  29.3 
 
 
284 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 
316 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
284 aa  129  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
284 aa  129  4e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
269 aa  129  4e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
264 aa  129  5e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
264 aa  129  5e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 
264 aa  129  5e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  28.91 
 
 
283 aa  129  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 
284 aa  129  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6122  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 
280 aa  127  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0193396  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
276 aa  128  1e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>