100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2676 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  67.96 
 
 
655 aa  875  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  92.15 
 
 
650 aa  1256  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  52.44 
 
 
653 aa  688  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  100 
 
 
650 aa  1345  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  66.01 
 
 
656 aa  917  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  92.46 
 
 
650 aa  1260  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  7.31399e-07 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  92.46 
 
 
650 aa  1258  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.35795e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  62.95 
 
 
663 aa  847  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  2.54716e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  53.51 
 
 
660 aa  654  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  92.15 
 
 
650 aa  1254  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.05402e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  98 
 
 
650 aa  1321  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  49.64 
 
 
667 aa  614  1e-174  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  1.045e-05  hitchhiker  6.06277e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  49.12 
 
 
656 aa  601  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.37992e-05  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  49.28 
 
 
671 aa  581  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  46.91 
 
 
671 aa  548  1e-154  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  34.16 
 
 
639 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  32.59 
 
 
639 aa  332  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  33.7 
 
 
639 aa  329  9e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  33.75 
 
 
639 aa  329  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  32.68 
 
 
639 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  33.69 
 
 
639 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  32.53 
 
 
639 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  32.18 
 
 
639 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  1.58979e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  32.66 
 
 
639 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  4.44921e-05 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  34.64 
 
 
640 aa  304  3e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  33.23 
 
 
639 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  32.74 
 
 
646 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  27.51 
 
 
764 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  34.13 
 
 
785 aa  176  9e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  26.36 
 
 
724 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  24.74 
 
 
722 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  26.16 
 
 
720 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  25.6 
 
 
729 aa  132  2e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  24.63 
 
 
725 aa  131  4e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  25.23 
 
 
730 aa  130  5e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  25.2 
 
 
730 aa  129  1e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  4.52412e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  25.07 
 
 
730 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.96014e-05  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  24.7 
 
 
719 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  24.5 
 
 
731 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.84393e-06  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  23.48 
 
 
727 aa  123  1e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  24.46 
 
 
724 aa  119  1e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  7.33685e-05  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  29.16 
 
 
745 aa  119  2e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  23.55 
 
 
731 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  26.48 
 
 
782 aa  116  1e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  24.32 
 
 
741 aa  114  8e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  4.2193e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  27.38 
 
 
735 aa  111  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  28.35 
 
 
738 aa  111  4e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  24.59 
 
 
745 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  26.52 
 
 
893 aa  101  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  25.26 
 
 
762 aa  101  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  7.40819e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  23.5 
 
 
764 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  27.79 
 
 
714 aa  95.5  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  4.68411e-07 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  25.62 
 
 
895 aa  90.9  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  29.41 
 
 
898 aa  90.5  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  29.08 
 
 
898 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  24.8 
 
 
762 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  6.43351e-05 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  29.08 
 
 
898 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  26.86 
 
 
716 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  21.64 
 
 
822 aa  87.8  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  24.58 
 
 
885 aa  87.8  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  24.31 
 
 
729 aa  87.4  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  2.80036e-08 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  23.01 
 
 
833 aa  86.7  1e-15  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  23.83 
 
 
762 aa  84.7  4e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  24.18 
 
 
809 aa  84.3  6e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1421  hypothetical protein  25.21 
 
 
657 aa  84.3  7e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  22.06 
 
 
766 aa  80.5  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  24.61 
 
 
761 aa  79  2e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  24.65 
 
 
761 aa  77.8  5e-13  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 
764 aa  77.8  6e-13  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  8.91097e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  24.39 
 
 
764 aa  77  9e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  23.86 
 
 
755 aa  76.6  1e-12  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  25.73 
 
 
945 aa  76.3  2e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  24.52 
 
 
770 aa  75.5  3e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  24.51 
 
 
820 aa  71.6  4e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  25.22 
 
 
788 aa  70.1  1e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  25.6 
 
 
826 aa  70.5  1e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  22.28 
 
 
789 aa  69.3  2e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  27.11 
 
 
758 aa  68.2  4e-10  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  25.33 
 
 
788 aa  68.2  5e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.27 
 
 
789 aa  67.4  7e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  22.19 
 
 
731 aa  66.6  1e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  22.35 
 
 
765 aa  66.6  1e-09  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  28.21 
 
 
741 aa  65.1  4e-09  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1356  hypothetical protein  22.56 
 
 
696 aa  61.6  5e-08  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0734371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0447  hypothetical protein  22.66 
 
 
612 aa  59.7  2e-07  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.476837 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  21.65 
 
 
700 aa  58.5  3e-07  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2990  hypothetical protein  22.29 
 
 
680 aa  58.5  3e-07  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  25.14 
 
 
778 aa  57  1e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  28.71 
 
 
1111 aa  57  1e-06  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  24.83 
 
 
843 aa  55.1  4e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  8.08171e-07 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0450  hypothetical protein  37.76 
 
 
687 aa  54.7  5e-06  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  20.72 
 
 
754 aa  54.3  8e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1409  hypothetical protein  26.32 
 
 
696 aa  52.4  3e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  24.57 
 
 
757 aa  50.8  7e-05  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.8 
 
 
816 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2580  hypothetical protein  22.57 
 
 
677 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4517  hypothetical protein  22.98 
 
 
642 aa  48.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.247929 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  25.15 
 
 
936 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  24.27 
 
 
538 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.97158e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3263  hypothetical protein  21.46 
 
 
655 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>