More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2517 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  88.73 
 
 		 275 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  86.18 
 
 		 275 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2738  biotin synthesis protein BioC  83.64 
 
 		 275 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2343  biotin biosynthesis protein BioC  61.96 
 
 		 269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1753  methyltransferase type 11  55.17 
 
 		 367 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.757271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1760  methyltransferase type 11  55.02 
 
 		 320 aa  290  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1797  methyltransferase type 11  52.32 
 
 		 374 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.105535  normal  0.766979 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2525  Methyltransferase type 11  51.48 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2774  biotin biosynthesis protein BioC  52.87 
 
 		 266 aa  264  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0014139  hitchhiker  0.00911196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  51.53 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1868  methyltransferase type 11  48.83 
 
 		 263 aa  248  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00760268  decreased coverage  0.000000322294 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1803  methyltransferase type 11  48.41 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1440  biotin synthesis protein BioC  47.95 
 
 		 248 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00159982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1477  methyltransferase type 11  46.12 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1660  methyltransferase type 11  43.21 
 
 		 309 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  34.72 
 
 		 260 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  32.42 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.3 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  32.34 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  32.95 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  34.24 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  33.87 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  33.73 
 
 		 274 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  32.4 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  32.54 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4684  biotin synthesis protein BioC  31.48 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.701434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  28.24 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  33.2 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.94 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0365  biotin biosynthesis protein BioC  31.75 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  29.43 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  32.51 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  30.6 
 
 		 325 aa  96.3  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  31.78 
 
 		 268 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  33.97 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1922  biotin biosynthesis protein BioC  28.68 
 
 		 279 aa  95.5  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152258  decreased coverage  0.00125244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2098  biotin biosynthesis protein BioC  29.6 
 
 		 309 aa  93.6  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  30.77 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  30.36 
 
 		 251 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2161  biotin biosynthesis protein BioC  30.34 
 
 		 291 aa  92.8  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30.36 
 
 		 251 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  40.37 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.36 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2555  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 315 aa  90.1  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00279696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  33.73 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  33.2 
 
 		 267 aa  89.7  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.57 
 
 		 255 aa  89.7  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  27.86 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  33.73 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  29.96 
 
 		 251 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  28.57 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4837  biotin biosynthesis protein BioC  30.43 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.672386 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  30.73 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.31 
 
 		 253 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  30.21 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  30.21 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  30.21 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  30.21 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  30.21 
 
 		 251 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 		 291 aa  85.5  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0960  biotin biosynthesis protein BioC  29.47 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.131557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.05 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  29.92 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  28.57 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  29.92 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  28.57 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  28.84 
 
 		 558 aa  82  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  28.31 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  30.91 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  28.2 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  30.1 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0322  biotin biosynthesis protein BioC  26.61 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0126192 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1981  biotin biosynthesis protein BioC  24.37 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1132  biotin biosynthesis protein BioC  24.13 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  38.74 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.39 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.01 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.75 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  26.37 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.46 
 
 		 272 aa  67.4  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 271 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  33.33 
 
 		 257 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  26.52 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1611  biotin synthesis protein  27.73 
 
 		 281 aa  63.2  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.03 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.56 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  37.78 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  37.37 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0573  putative methyltransferase  27.27 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>