286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2359 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2359  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000764898  decreased coverage  0.000016732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1877  transposase, putative  88.46 
 
 
92 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.350595  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2340  transposase IS3/IS911 family protein  71.05 
 
 
92 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03535  predicted IS protein  69.74 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.924615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3340  transposase IS3/IS911 family protein  69.74 
 
 
112 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0763009  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03480  hypothetical protein  69.74 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3407  transposase IS3/IS911 family protein  69.74 
 
 
118 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3971  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000376066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3022  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00292237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2789  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.013431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0436  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0346  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0509042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0280  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1990  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000327529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1261  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.046815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0325  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.196335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4530  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.66022  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0142  ISEhe3, transposase orfA  69.74 
 
 
92 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000709796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2232  transposase IS3/IS911 family protein  87.72 
 
 
72 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.13985  normal  0.028458 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2065  ISEhe3, transposase orfA  68.42 
 
 
92 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000139393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1785  transposase IS3/IS911 family protein  67.53 
 
 
90 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.496155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0891  transposase IS3/IS911 family protein  60.49 
 
 
97 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444213  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4424  transposase IS3/IS911 family protein  60.49 
 
 
97 aa  98.2  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4708  transposase IS3/IS911 family protein  63.16 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879601  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5456  transposase DNA binding site ISRme11  65.82 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0552744  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5496  transposase DNA binding site ISRme11  65.82 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1348  transposase and inactivated derivatives  59.21 
 
 
92 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3805  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2972  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.908697  normal  0.454882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5424  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.175663  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1613  transposase IS3/IS911 family protein  62.96 
 
 
92 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02980  ISxac3 transposase  53.85 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02989  ISxac3 transposase  53.85 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2029  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0100049  normal  0.0526351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3134  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0609  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0388  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4160  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2266  transposase IS3/IS911 family protein  55.26 
 
 
92 aa  88.2  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.101056  hitchhiker  0.00760837 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1845  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 
92 aa  88.6  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4258  transposase IS3/IS911 family protein  53.09 
 
 
93 aa  87.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1548  transposase  61.04 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.34059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0645  ISxac3 transposase  52.63 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2459  ISxac3 transposase  52.63 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.687563  normal  0.393971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1532  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3180  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2219  transposase IS3/IS911 family protein  53.75 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0419  transposase IS3/IS911 family protein  59.21 
 
 
78 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1672  transposase IS3/IS911 family protein  51.32 
 
 
383 aa  82  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2465  transposase IS3/IS911 family protein  52 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208677  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0563  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0378467  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2664  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916109  normal  0.368485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0684  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0860261  normal  0.453264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4444  transposase family protein  58.21 
 
 
84 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.327316  hitchhiker  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4074  transposase IS3/IS911 family protein  48.68 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.96414  normal  0.0736148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0733  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.903269  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0361  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
94 aa  70.9  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00503  hypothetical protein  55.17 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0158  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3405  transposase IS3/IS911 family protein  47.37 
 
 
94 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00509  hypothetical protein  55.17 
 
 
73 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0581653  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3919  transposase IS3/IS911 family protein  44.74 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.663613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2846  transposase IS3/IS911 family protein  44.87 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3390  transposase IS3/IS911 family protein  42.11 
 
 
94 aa  62.4  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4146  ISxac3 transposase  70.73 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4083  ISxac3 transposase  70.73 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.151161  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0739  putative transposase  62.79 
 
 
43 aa  52.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.646917  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0536  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.88 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0864  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.88 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.125003  normal  0.947274 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1452  IS1329/IS3/IS911 transposase  34.88 
 
 
103 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.319621 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2278  transposase IS3/IS911  36.25 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0569  hypothetical protein  29.63 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1014  transposase IS3/IS911 family protein  40.68 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0185  hypothetical protein  29.63 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0197  hypothetical protein  29.63 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1110  hypothetical protein  29.63 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1577  hypothetical protein  29.63 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1584  hypothetical protein  29.63 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2631  transposase IS3/IS911 family protein  46.51 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1741  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.26041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4601  transposase IS3/IS911 family protein  35 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6035  transposase IS3/  37.65 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1469  transposase IS3/IS911 family protein  34.78 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.367264  normal  0.119554 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2549  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.848876  normal  0.046811 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4661  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.935121  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4654  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4595  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.267513  normal  0.816479 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3669  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 
101 aa  47  0.00008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.86487  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  34.57 
 
 
386 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2172  ISSod1, transposase OrfA  47.73 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1819  transposase-like  34.94 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000000000187587  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>