73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2087 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 283 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  96.11 
 
 		 283 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  95.9 
 
 		 283 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  57.76 
 
 		 289 aa  286  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  56.99 
 
 		 286 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  53.05 
 
 		 297 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  51.94 
 
 		 303 aa  255  5e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  56.27 
 
 		 307 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  55.31 
 
 		 285 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  48.94 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.47 
 
 		 295 aa  250  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  46.48 
 
 		 285 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  44.44 
 
 		 297 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  46.18 
 
 		 302 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  41.22 
 
 		 304 aa  226  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  44.76 
 
 		 288 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  51.87 
 
 		 290 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  52.61 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  46.98 
 
 		 302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  46.79 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  52.61 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  41.78 
 
 		 311 aa  204  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  55.4 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  43.86 
 
 		 297 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  44.1 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  38.78 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  40.79 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  54.51 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  42.36 
 
 		 289 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  41.09 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  40.6 
 
 		 254 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  46.49 
 
 		 282 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.85 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  55.77 
 
 		 285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  55.38 
 
 		 281 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  50 
 
 		 194 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  42.55 
 
 		 287 aa  170  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.55 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.48 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  40.16 
 
 		 302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  38.46 
 
 		 275 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  43.46 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  48.06 
 
 		 319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.51 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.94 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2564  hypothetical protein  27.85 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  24.38 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2588  hypothetical protein  27.85 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0344975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1953  hypothetical protein  27.85 
 
 		 293 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5896  hypothetical protein  27.4 
 
 		 321 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  28.31 
 
 		 303 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  27.85 
 
 		 303 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.39 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2135  hypothetical protein  26.85 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0459408  normal  0.325702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  25.62 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2089  hypothetical protein  29.23 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.920786  normal  0.915824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0441  hypothetical protein  26.5 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  26.01 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  24.87 
 
 		 304 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  25.49 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3305  catalase  36.62 
 
 		 169 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831237  normal  0.371892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.57 
 
 		 301 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.04 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  25.28 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0519  hypothetical protein  27.72 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0144274 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>