78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2083 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  78.86 
 
 
628 aa  1078  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  78.23 
 
 
627 aa  1068  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  4.34172e-05  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
634 aa  1332  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  3.21687e-08 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  98.42 
 
 
634 aa  1311  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  98.42 
 
 
634 aa  1310  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  7.18487e-06  hitchhiker  3.98389e-05 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  45.44 
 
 
607 aa  537  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.39 
 
 
466 aa  292  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.51 
 
 
353 aa  245  1e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  41.53 
 
 
329 aa  237  4e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.82 
 
 
350 aa  222  2e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.26 
 
 
376 aa  216  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.57 
 
 
340 aa  216  8e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  37.33 
 
 
502 aa  216  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.38 
 
 
507 aa  207  5e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.8 
 
 
347 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  39.1 
 
 
517 aa  202  1e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.12 
 
 
355 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2200  alpha-N-arabinofuranosidase  74.11 
 
 
112 aa  176  1e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.198981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  32.8 
 
 
355 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2308  alpha-N-arabinofuranosidase  71.43 
 
 
112 aa  166  1e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.244372  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  34.38 
 
 
349 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 
580 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.14 
 
 
648 aa  155  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.68 
 
 
362 aa  143  8e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.45228e-11  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  33.53 
 
 
344 aa  142  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  6.31807e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.01 
 
 
316 aa  140  8e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  31.94 
 
 
340 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 
316 aa  138  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.5 
 
 
316 aa  138  3e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  32.28 
 
 
341 aa  138  3e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 
316 aa  138  3e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 
316 aa  137  6e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  27 
 
 
392 aa  137  6e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 
316 aa  137  7e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  30.63 
 
 
316 aa  137  7e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.33 
 
 
426 aa  136  1e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.85 
 
 
315 aa  132  2e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.68 
 
 
378 aa  131  4e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.32 
 
 
315 aa  129  1e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.68 
 
 
378 aa  129  2e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.06 
 
 
369 aa  129  2e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.18 
 
 
505 aa  128  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  26.17 
 
 
2073 aa  127  4e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.64 
 
 
315 aa  127  4e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  26.75 
 
 
377 aa  120  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.83532e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.85 
 
 
314 aa  113  1e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.14 
 
 
333 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.14 
 
 
333 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 
333 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.71617e-06 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  25.92 
 
 
1278 aa  90.5  9e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  25.36 
 
 
672 aa  81.6  4e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.2 
 
 
315 aa  75.5  3e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  24.55 
 
 
713 aa  70.5  1e-10  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  31.47 
 
 
710 aa  60.5  1e-07  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  21.53 
 
 
537 aa  58.2  4e-07  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  20.77 
 
 
487 aa  56.2  2e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  30.88 
 
 
566 aa  55.5  3e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  21.71 
 
 
510 aa  54.3  6e-06  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.74 
 
 
474 aa  53.9  9e-06  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  27.92 
 
 
963 aa  52.4  3e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  29.41 
 
 
582 aa  52  3e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 
340 aa  51.2  6e-05  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.62 
 
 
520 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  25.56 
 
 
1413 aa  48.9  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  28.85 
 
 
436 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  26.03 
 
 
412 aa  48.1  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.63 
 
 
306 aa  47.8  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40158e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  26.73 
 
 
691 aa  47.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.89 
 
 
334 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.14 
 
 
863 aa  47  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  4.01461e-07 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.66 
 
 
345 aa  46.2  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.95 
 
 
507 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.71 
 
 
304 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  25.93 
 
 
503 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  23.77 
 
 
503 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  22.15 
 
 
401 aa  44.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0316  hypothetical protein  34.69 
 
 
97 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0126894  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  24.37 
 
 
319 aa  44.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>