65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2078 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2078  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 333 aa  700    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000171617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1991  Alpha-N-arabinofuranosidase  97.9 
 
 		 333 aa  687    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535361  hitchhiker  0.0025818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1983  Alpha-N-arabinofuranosidase  97.9 
 
 		 333 aa  687    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131157  hitchhiker  0.000323815 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  48.77 
 
 		 580 aa  332  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2053  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.94 
 
 		 315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.17 
 
 		 505 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1366  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.63 
 
 		 648 aa  308  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2154  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.87 
 
 		 315 aa  305  6e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0709531  normal  0.0185421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4015  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.9 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.374265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1392  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.79 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.973164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1990  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.32 
 
 		 378 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0777  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.9 
 
 		 314 aa  292  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.12655 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1984  Alpha-N-arabinofuranosidase  46.01 
 
 		 378 aa  291  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.807412  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2077  glycoside hydrolase family protein  45.71 
 
 		 377 aa  290  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183532 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0656  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.94 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0787  Alpha-L-arabinofuranosidase  45.06 
 
 		 362 aa  285  9e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000245228  normal  0.585497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03050  predicted beta-xylosidase  45.21 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28680  predicted beta-xylosidase  45.54 
 
 		 341 aa  279  6e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0168  alpha-N-arabinofuranosidase 2  43.81 
 
 		 316 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2055  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.31 
 
 		 369 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0162  alpha-N-arabinofuranosidase 2  43.5 
 
 		 316 aa  272  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0160  alpha-N-arabinofuranosidase 2  43.5 
 
 		 316 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2151  Alpha-N-arabinofuranosidase  44 
 
 		 392 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.923723  normal  0.103273 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0161  alpha-N-arabinofuranosidase 2  43.2 
 
 		 316 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0165  alpha-N-arabinofuranosidase 2  43.2 
 
 		 316 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.124224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1547  putative beta-xylosidase  44.11 
 
 		 344 aa  266  5e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.000000631807  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0501  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.06 
 
 		 426 aa  238  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1165  normal  0.486336 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3393  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.51 
 
 		 350 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.179766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0353  Alpha-N-arabinofuranosidase  37.72 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.96 
 
 		 355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3081  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.06 
 
 		 347 aa  146  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.174999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2025  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.11 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.620669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.63 
 
 		 507 aa  135  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.83 
 
 		 2073 aa  133  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3395  glycoside hydrolase family 43  33.57 
 
 		 355 aa  129  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02533  glycosyl hydrolase, family 43, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01660)  30.38 
 
 		 329 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.63 
 
 		 466 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3926  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.54 
 
 		 353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0791  Alpha-L-arabinofuranosidase  29.39 
 
 		 607 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.570389  normal  0.122086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2237  glycoside hydrolase family 43  29.71 
 
 		 349 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.572744  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  30.25 
 
 		 627 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.03 
 
 		 628 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1979  glycoside hydrolase family protein  28.78 
 
 		 634 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00334232  hitchhiker  0.000434537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1996  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 		 634 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000718487  hitchhiker  0.0000398389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2083  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 		 634 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000179948  decreased coverage  0.0000000321687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6193  glycoside hydrolase family 43  30.66 
 
 		 502 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1082  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.18 
 
 		 517 aa  92.4  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.286531 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  28.42 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1544  putative beta-xylosidase  22.65 
 
 		 710 aa  66.6  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.099307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4199  glycoside hydrolase family 43  24.83 
 
 		 1278 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.45421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  24.63 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  23.97 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  23.75 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.43 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  25.1 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  23.27 
 
 		 713 aa  52  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  22.37 
 
 		 341 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  25.89 
 
 		 306 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  24.45 
 
 		 699 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  25.41 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  22.89 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  23.61 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  23.27 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  23.58 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  22.43 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>